先天性巨细胞包涵体病患儿病死率高，后遗症较多。尤其有黄疸、血小板减少、颅内钙化和肝脾肿大者预后不良。多死于肝硬变，存活者常遗留性的神经系统后遗症，如小头畸形、智力低下、发育及运动障碍、耳聋等。但也有一些宫内感染的婴儿能够存活而无明显后遗症。后天获得性巨细胞包涵体病多为自限性，预后较好。但原有严重的慢性消耗性疾病、器官移植、AIDS患儿或长期应用免疫抑制剂者预后不良。
巨细胞包涵体感染是由巨细胞病毒cytomegalovirus ，CMV引起的先天性或后天性感染，有两种类型，多数成为唾液腺的不显性感染或慢性感染而长期存留。另一种是全身性疾病，称巨细胞包涵体病cytomegalic inclusion disease，比较少见，主要侵犯小婴儿，其特点是在很多器官组织内发现含核内和胞浆内包涵体的巨大细胞，并伴有全身症状，是宫内病毒感染导致胎儿畸形的重要原因之一。
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