虽然熟地黄是临床颇为常用的一味滋补中药，但仍有许多禁忌需要注意。
一、炮制煎煮不可见铜铁器。
《雷公炮制药性解云：“采得生地黄，去白皮，磁锅上柳木甑蒸之，摊令气歇，拌酒，再蒸，又出令干，勿令犯铜铁，令人肾消，并白发，男损营，女损卫也。”熟地黄炮制不可见铜铁，煎煮亦不可用铁锅、铁壶。《药鉴：“若犯铁器，令人肾消。”贮藏应如《本草从新言，“味甘如饴，须瓷器收之，以其脂柔喜润也”。
二、服食忌萝卜、三白、诸血等。
《本草品汇精要记载：忌萝卜、葱白、韭白、薤白。《要药分剂云“忌莱菔、葱、蒜、诸血”。盖莱菔子降气，三白辛窜走气，影响地黄的滋补作用。诸血为血肉有情之品，恐滋腻太过，故宜禁之。
三、伤寒家不宜用。
伤寒之病，邪从外入，宜疏散而不宜滋补。如《神农本草经百种录言：“又仲景《伤寒一百十三方，惟复脉用地黄。盖伤寒之病，邪从外入，忌滋滞。即使用补，必兼疏拓之性者，方可入剂。否则邪气向里，必有遗害。今人一见所现之证，稍涉虚象，便以六味汤为常用之品，杀人如麻，可胜长叹。”
四、脾虚痰多气郁之人慎服。
熟地黄味甘，性尤滋腻，脾虚痰多气郁者慎用。《本草从新云：“按熟地黄性滞，痰多、气郁之人，能窒碍胸膈，用宜斟酌。”《本草征要云：“熟者性滞，若痰多气郁之人，能窒碍胸膈，当斟酌用之。”《本草通玄言“熟地性滞，痰多者，恐其泥膈，宜姜汁炒之，以制其滞。更须佐以砂仁、沉香二味，皆纳气归肾，又能疏地黄之滞，此用药之权衡也”。