四川大学华西医院肝胆胰外科是全国重点学科、卫生部重点学科。肝胆胰外科诊治范围包括肝脏、胆道、胰腺、十二指肠及腹膜后肿瘤等相关疾病的外科治疗、腹腔镜外科诊治，并负责相关疾病的基础与临床研究工作。
　　肝胆胰外科共有医师11人，包括教授8人，副教授2人，讲师1人。其中博士、硕士研究生导师9人，多位医师先后在美国、日本、瑞士、德国等著名大学留学或研修。护理人员共28人，包括主管护师4人，护师1人，本科学历1人。
　　肝胆胰外科所含专业近年来开展了一系列新技术、新疗法，包括肝脏移植（尸肝移植和成人间活体肝移植）处于国内领先、国际一流，为终末期肝病患者获得了新生；复杂肝癌切除术、肝尾叶肿瘤累及第二、三肝门切除，肝癌行海扶刀（超声聚焦）治疗、射频治疗、介入治疗、I125粒子植入等综合治疗，提高了肝癌患者的生存期和生存质量；率先在国内开展了利用CUSA不阻断入肝血流的切肝技术，极大地减低了肝脏手术的并发症；率先开展了术中实时超声造影技术，大大提高了肝癌的切除率。在重症急性胰腺炎的治疗方面积累了丰富的经验，提出了中西医结合治疗、手术时机的选择和手术新方法等新的理念，并成为同行业诊治的规范，将重症急性胰腺炎的救治成功率提高到90%以上，达到国际领先水平；同时在胰腺癌和胰腺内分泌肿瘤诊断治疗具有较高的水平；开展了复杂的胰头癌根治术和胰体尾癌根治性切除术；开展区域化疗和I125胰腺植入放疗，提高了药物对肿瘤的靶向杀伤效应，减少了副作用，有效提高胰腺癌患者的生存率，显著改善患者的生活质量；在慢性胰腺炎外科治疗领域，在国内率先开展了保留十二指肠的胰头切除、钩突切除、保留脾脏的胰体尾切除等新型手术，是中华外科学会颁布的治疗指南的执笔单位。也是全国为数不多的胰腺移植中心，成功开展了胰肾联合移植术，使一些晚期糖尿病患者获得新生。腹腔镜外科开展了腹腔镜脾脏切除术、门奇断流术、肝叶切除术、胆总管切开取石术、肝囊肿去顶减压术、肝脓肿切开引流术、腔镜下甲状腺切除术、腔镜下联合胸外科行食管贲门肌层切开加胃底折叠术治疗贲门失弛缓症以及腹腔镜下胃底折叠术治疗反流性食管炎等，减轻了患者的痛苦，缩短了住院时间。
　　肝胆胰外科有卫生部肝胆胰疾病研究室，为国家重点学科。获得国家教育部科技进步一等奖1项，中华医学会科技进步三等奖1项，四川省科技进步成果奖一等奖2项、三等奖4项，成都科技进步成果奖2项。主编、参编专著：《肝脏外科》、《现代肝脏移植学》、《急性胰腺炎》《实用普通外科手术学》、《活体肝脏移植》等，每年发表专业论文约30余篇。现有国家、省部级、学校科研项目约10项，科研经费200余万元。
　　肝胆胰外科承担了博士研究生，硕士研究生，临床医学八年制、七年制、五年制，留学生及护理专业的教学和临床技能培训，先后培养出博士研究生20余人，硕士40余人。现在读博士研究生6人，硕士研究生10人。同时承担了国家继续教育项目及国内及省内医疗护理支援工作。