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急性期应与伤寒、钩端螺旋体病、布氏杆菌病、Q热及病毒性感染等发热疾病相鉴别。一旦肺部出现病变及呼吸道症状时，应与细菌性肺炎鉴别。细菌性肺炎主要有感染性和理化性如放射线、毒气、药物以及变态反应性如过敏性肺炎等，临床所见绝大多数为细菌、病毒、衣原体、支原体、立克次体、真菌和寄生虫等引起的感染性肺炎，其中以细菌最为常见。
若病情较轻而又咳嗽不止时应与衣原体肺炎(衣原体肺炎的病原为肺炎衣原体(chlamydia pneumoniae)，是新发现的一种衣原体，主要引起呼吸道和肺部感染，声音嘶哑、干咳、有时发热、咽痛等咽炎)鉴别。剧烈头痛应与脑膜炎(此病通常伴有细菌或病毒感染身体任何一部分的并发症，比如耳部、窦或上呼吸道感染。)鉴别。
