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应与病毒性肺炎、细菌性肺炎及支原体肺炎相鉴别,当肺炎不能用细菌、病毒、支原体感染来解释,且用青霉素、头孢菌素治疗不佳时,应想到衣原体感染的可能。可进行衣原体抗原及血清学检查,尤其6个月以内小婴儿患无热性肺炎时,更应考虑到本病。