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男生殖系结核的感染途径有二：
①血行感染：男生殖系结核的发病与肾结核相同，均为身体其他器官结核病灶的继发性病变。结核杆菌由血液侵入男生殖系统。
②尿路感染：在肾结核的基础上，结核杆菌由尿液侵入男生殖系统，因此也是肾结核的继发性病变。同时肾结核病变越严重，合并男生殖系结核的机会也越多。
在一组143例肾结核病例中，粟粒性肾结核并发男生殖系结核为13%，干酪样肾结核中为58%，空洞型肾结核中为100%。目前认为男生殖系结核不论经血行感染或尿路感染往往由前列腺、精囊开始以后蔓延到输精管，再从输精管管腔或管壁淋巴管蔓延到附睾，在附睾尾部发生病变后再扩展到附睾的其他部分和睾丸。从血行感染的男生殖道结核可直接引起附睾结核，这种感染常在附睾头部开始。在临床上常为尿路感染而血行感染较为少见。
