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潜伏期8～30天，平均为18天。患者大多无前驱期症状，而以耳下部肿大为首发病象，少数病例可有短暂非特异性不适(数小时至2天)，可出现肌肉酸痛、食欲不振、倦怠、头痛、低热、结膜炎、咽炎等症状。近10多年来我国流腮病情较前加重，表现为热程长，并发症增多，住院患儿占门诊患儿的比例也增高。
起病大多较急，有发热、寒意、头痛、咽痛、食欲不佳、恶心、呕吐、全身疼痛等，数小时至1～2天后，腮腺即显著肿大。发热自38～40℃不等，症状轻重也很不一致，成人患者一般较严重。腮腺肿胀最具特征性，一侧先肿胀，但也有两侧同时肿胀者;一般以耳垂为中心，向前、后、下发展，状如梨形而具坚韧感，边缘不清。当腺体肿大明显时出现胀痛及感觉过敏，张口咀嚼及进酸性饮食时更甚。局部皮肤紧张发亮，表面灼热，但多不红，有轻触痛。腮腺四周的蜂窝组织也可呈水肿，可上达颞部及颧骨弓，下至颌部及颈部，胸锁乳突肌处也可被波及(偶尔水肿可出现于胸骨前)，因而使面貌变形。
通常一侧腮腺肿胀后1～4天(偶尔1周后)累及对侧，双侧肿胀者约占75%。颌下腺或舌下腺也可同时被波及，颌下腺肿大时颈部明显肿胀，颌下可扪及柔韧而具轻触痛的椭圆形腺体：舌下腺也可同时被累及，舌下腺肿大时可见舌及颈部肿胀，并出现吞咽困难。
腮腺管口(位于上颌第二磨牙旁的颊黏膜上)在早期常有红肿。唾液分泌初见增加，继因潴留而减少，但口干症状一般不显著。
腮腺肿胀大多于1～3天到达高峰，持续4～5天逐渐消退而回复正常。整个病程约10～14天。
不典型病例可无腮腺肿胀而以单纯睾丸炎或脑膜脑炎的症状出现，也有仅见颌下腺或舌下腺肿胀者。
