重庆医科大学附属第二医院泌尿外科成立于1979年，经过30多年的发展，科室建设不断壮大。现有展开床位45张，床位使用率达150%。医护人员24人，主系列医生9名，其中教授2名，副教授5名，博士学位6人。科室常年开设男科、结石、前列腺、血尿、肿瘤等各类专科门诊，年门诊量2万多人次，年收治病人2000余人次。
　　科室承担重庆医科大学临床医学二系、儿科系、预防医学系、影像系、生物医学工程系和七年制教学任务。1985年设硕士学位培养点，2004年设立博士学位培养点。现有博士生导师1名，硕士导师3名，2006年以来，培养博士研究生2名，硕士研究生26名，各类进修生70余名；主编及参编专著数部；近年来，科室获得多项国家、市、院级科研课题，并参与国家“九五”重点科技攻关项目，国家自然科学基金项目等的研究。累计科研经费达200余万元；在统计源期刊发表论文100余篇，在国外高水平期刊上发表SCI收录论文5篇；获市科技奖5项。科室先后派人赴国外及国内泌尿外科中心学习，为科室的进一步发展奠定了坚实的人才基础。
　　能够熟练诊治泌尿生殖系统常见病，多发病及各种疑难杂症．对于泌尿系肿瘤及结石，前列腺疾病，排尿功能障碍，生殖功能障碍，男性学的诊断和治疗都有丰富的经验及独特的方法，目前能够熟练完成泌尿系统的各类腔镜及开放手术包括：肾移植术；肾上腺肿瘤切除术、前列腺摘除术、肾肿瘤肾部分及肾切除术；复杂型肾盂及肾实质切开取石术，肾实质、输尿管、膀胱切开取石术；全膀胱切除肠代膀胱术；尿道下裂修补术、阴茎延长整形术等。开放手术始终保持在重庆市的领先地位，同时还开展了所有腔内微创手术：如经尿道前列腺等离子电切术、膀胱肿瘤电切术、腹腔镜下前列腺癌根治术、经后腹腔镜肾上腺切除术、肾切除术、肾囊肿切除术、肾部分切除术、经皮肾取石术、输尿管镜气压弹道碎石术、体外震波碎石术等.。
　　科室设有体外冲击波碎石中心、腔镜治疗室、尿动力检查室等，拥有腹腔镜、输尿管镜、电子膀胱镜、前列腺及膀胱肿瘤电切镜、前列腺等离子电切镜、超声碎石系统、尿动力学检查仪、美国尼娃夜间阴茎胀大测定仪、体外冲击波碎石机等先进仪器设备。
　　科室特色：
　　一、前列腺治疗：
　　1、包括前列腺增生的微创治疗（等离子、汽化电切、钬激光等）
　　2、前列腺炎腔道微创及红外线热疗等。
　　二、泌尿系结石治疗：
　　包括体外冲击波碎石、经皮肾镜碎石取石、输尿管镜气压弹道或钬激光以及超声碎石术等。
　　三、泌尿系肿瘤微创治疗：
　　1、包括腹腔镜肾上腺切除、肾癌根治术、肾部分切除、肾盂成形术、肾囊肿切除、前列腺癌根治、膀胱全切术等手术。
　　2、膀胱肿瘤电切或等离子电切等。
　　四、男科学、不孕不育专科：专治男性性功能障碍（阳痿、早泄）、难治性前列腺炎、男性不育不孕等。