中医科始建于1955年。由衢州一代名医叶伯敬、祝蔚文、龚香圃加盟组成，并带出了林钦甫、刘宽成、陈炎彰、钟文炎等一代中医内儿科名医。1979年中医妇科名医邵德隆进入该院中医科。使中医科在中医内妇儿科方面均衡发展，之后陈珍治、吴冰玲进入中医科，使中医妇科成为中医科的一大强项。为了中医的传承和发展，邵德龙和林元秀、林钦甫和徐青霞、钟文炎和姜丕政成立了正式的师徒关系。经过五十余年的发展，中医科人才辈出，临床治疗专长覆盖诸科。在消化、内分泌、肝胆疾病、恶性肿瘤、妇科、儿科等疾病的防治方面充分发挥中医药优势，与现代医学相互补，取得了很好的疗效，显示出中医独特的优势。目前中医科有省级名医1名，主任医师3名，傅主任医师2名，医师2名。年门诊量约6万人次。中医治疗范围：1.内科病：慢性胃炎、胃溃疡、结肠炎、急慢性肝炎、胆结石、急慢性肾炎、心脑血管疾病、急慢性支气管炎、肺气肿、哮喘等；2.妇儿科病：月经不调、痛经、盆腔炎、不孕等；儿科：发热、哮喘、肺炎、肾炎、消化不良等；3.各种肿瘤：肺癌、肝癌、消化道癌、脑癌、淋巴癌、子宫癌、乳腺癌、前列腺癌等；4.心身疾病：失眠、抑郁、焦虑状态及机体亚健康状态的调节；5.男性病：男性不孕、急慢性前列腺炎、前列腺增生等；6.皮肤病：痤疮、黄褐斑、荨麻疹、湿疹等。