中山大学附属第三医院病理科成立于1986年，集医疗、教学、科研工作于一体；为病理硕士点、博士点和博士后流动站，是广东省临床重点专科单位及卫生部病理专科医师培训基地。现有员工39人，其中病理医师20人，技术人员17人，工勤人员2人。医师队伍均具备研究生以上学历，其中高级职称4人，中级职称9人；技术人员高级职称3人，中级职称2人。
　　中山三院病理科拥有常规病理技术室、细胞病理室、免疫组织化学室和分子病理室。可开展常规病理诊断、快速石蜡病理诊断、术中冰冻快速病理诊断、细胞病理诊断、尸体解剖、疑难病理会诊、远程病理会诊；可进行全自动免疫组化检测、分子病理检测、循环肿瘤细胞检测等项目。年组织活检量3万余例，冰冻标本约3千余例，细胞学2万余例，年均增长量约15%。远程病理会诊可满足我院四院区的疑难病理诊断及基层医院病理远程会诊，亦可参与国内外著名病理诊断中心的疑难病理远程会诊。现已开展肝脏病理、乳腺及女性生殖病理、骨与软组织病理、淋巴造血病理、泌尿生殖病理、神经病理、皮肤病理、内分泌病理等亚专科。依托我院肝病学科的优势，病理科在肝脏病理方面具有较高的诊断水平及较广泛的影响力。已连续多年举办肝脏病理学习班，并获全国各地学员的一致好评。
　　中山三院病理科是广东省高水平临床重点专科，作为病理专科医师培训基地及研究生培养点，目前已有三十余名住院医师接受或已完成病理专科培训，已培养博士研究生7名，硕士研究生10名，在读博士生3名，硕士生1名。近五年来，科研上承担二十余项国家及省部级课题，其中主持国家自然科学基金项目12项，发表论文300余篇，其中SCI论文50余篇，最高影响因子12.042 (Autophagy. 2012;8(3):389-400.)。参与完成10余本医学书籍的撰写工作，并拥有国家专利一项。部分研究成果受邀在国际学术会议上发言，科研团队获2019年首届广东省医学科技奖二等奖。