中山大学附属第三医院感染性疾病科创建于1954年。1978年成为首批硕士学位授予点，1983年被批准为博士点，至今共培养硕士研究生97人，博士研究生48人。1988年成为中山医科大学重点学科，同年被批准为卫生部(现转为“国家药品监督管理局”)抗肝炎药品及抗寄生虫药品临床研究基地。1994 年被评为省高校重点课程。1996 年被评为广东省“五个一科教兴医工程”重点专科，同年成为广东省住院医生培训基地，中山医科大学博士后流动站。1997 年成为卫生部医师继续教育培训基地。1998年被评为中山医科大学“211工程”重点学科。1999 年被评为广东省重点学科。2000年被评为广东省唯一的一个临床学科省级优秀课程。2005年成为中山大学校级精品课程。2006年为广东省级精品课程。2008年被评为广东省“十一五”医学重点专科。专科开设普通病区5个，ICU病区1个，实验中心1个，示教室5个，多功能课室1个。现有医务人员138人，医师54人，其中正高职称9人，副高职称15人。医师中多数有硕士以上学位。有博士生导师5人，硕士生导师13人。2003年以来，获973项目1项，卫生部公益行业基金1项，国家自然科学基金6项，省部级科研基金16项，厅局级科研基金17项;发表科研论文370多篇，其中SCI论文18篇;获省级科研成果1项，市级科研成果1项。从1988年起为五年制高校统编教材《传染病学》主编单位;2000年成为七年制高校统编教材《传染病学》主编单位;2004年成为八年制高校统编教材《传染病学》主编单位，主编了多部高校统编教材。

感染性疾病科现有病床197张，以收治肝炎病人为主，出院病人2000人次/年，年救治肝衰竭病人400余例;门诊量约13万人次，每年院外会诊约150～200人次。专科建立了乙型肝炎由随访门诊的抗病毒治疗到重型肝炎的分层治疗;完成10余项一类新药的验证;承担脑膜炎、发热性疾病等各类传染病的收治;同时作为中山大学唯一的传染病教研室，承担所有医学生传染病学的教学任务。