北京中日友好医院消化内科是该院重点科室之一，北京市中西医结合肝病学会主任委员单位，国家中医药管理局中西医结合临床国家重点学科。北京协和医学院、北京大学医学部和北京中医药大学的博士和硕士培养单位，北京市亚专科医师内科培训基地，卫生部内镜诊疗技术培训基地。现有主任医师7名、副主任医师7名，其中博士研究生导师1名、硕士研究生生导师5名。消化内科由门诊、病房、内镜中心、微创治疗组、胃肠动力检查室、消化科实验室组成，年门诊量12万余人次，设有病床53张，年收治病人1600余人。拥有面积达620 M2的大型内镜诊疗中心，每年内镜诊治患者超过23000例次，中心制定了严格的内镜消毒制度，配有先进的内镜消毒系统，避免了2次污染。其中消化道息肉电切术、消化道早期肿瘤粘膜切除术、食管胃底静脉曲张硬化和套扎治疗、胰胆管造影及十二指肠乳头括约肌切开治疗胆总管结石、贲门失弛缓症水囊扩张治疗及消化道（食管、十二指肠、大肠、胰胆管等）狭窄扩张和支架置入、超声内镜诊断等在国内均属先进水平。
　　北京中日友好医院消化内科以慢性肝病、消化系病的内镜诊治、功能性胃肠疾病和胃肠动力障碍性疾病以及炎症性肠病为主要研究方向，以中西医结合为特色，先后承担“重大新药创制”科技重大专项“十二五”实施计划课题、国家“十一五”科技支撑计划常见病课题、国家自然科学基金项目、卫生公益性行业科研专项课题、北京市科委课题、首都医学发展基金等国家和省部级课题20余项，获省部级科技进步奖9项，研制成功4种治疗肝病的中成药。学科人才梯队合理，不仅有国内知名专家教授，而且在消化病理、内镜诊治、肿瘤分子生物学、腹腔镜手术等方面都拥有高水平的专业技术人员，与日本、美国、加拿大、丹麦、英国等国家的医学院校的相关学科及研究院所建立了稳定的合作关系，定期进行学术交流和人才培养，注重教学和管理，是集临床、教学、科研为一体的消化疾病中心。
　　北京中日友好医院消化内科现分7个专业学组，包括食管胃部疾病学组、大肠疾病学组、胰胆学组、胃肠动力学组、肝病学组、炎症性肠病学组和超声内镜学组。食管胃部疾病学组的主要研究方向是消化道早期癌的诊治研究；大肠疾病学组的主要研究方向是结直肠癌的个体化治疗、靶向治疗、耐药及转移相关基因/蛋白的研究，直肠癌的综合微创治疗；胰胆学组的主要研究方向是胆总管结石、胰管结石、梗阻性黄疸、胰胆肿瘤的诊治；胃肠动力学组的主要研究方向是功能性消化不良的个体化治疗，功能性和动力障碍性胃肠病的诊治；肝病学组的主要研究方向是慢性肝病的中西医结合综合治疗，清肝化瘀方治疗肝癌的目标基因的寻找及相关机制的研究，肝硬化、肝癌的早期诊断和筛查；炎症性肠病学组的主要研究方向是克罗恩病和溃疡性结肠炎的发病机制研究、个体化治疗和综合治疗的研究；超声内镜学组的主要研究方向是消化道肿瘤的浸润深度以及与淋巴结转移的相关性研究，超声内镜下穿刺检查及治疗。
　　医疗特色：
　　1、消化道早期癌的内镜下诊治：消化道早期癌局限于粘膜或粘膜下，预后与进展期癌有很大差别。科主任赵洪川教授长期从事消化道早期癌的研究，早年曾赴日本学习，通过色素内镜、放大内镜、超声内镜，从癌前病变中筛选早期癌，在此基础上开展早期癌的内镜下治疗，包括内镜下粘膜切除术（EMR）、内镜粘膜下剥离术（ESD），远期疗效确切。同时在国内较早开展消化道大息肉内镜下治疗，切除最大息肉直径6cm，每年切除大息肉500余例。
　　2、直肠癌的综合微创治疗：消化内科暨内镜中心微创治疗组以术前联合放化疗与腹腔镜微创手术相结合为特点，采取癌症治疗的最新模式，与放疗科、放射科、中医肿瘤科、病理科等肿瘤治疗相关科室合作，致力于为直肠癌患者提供规范化、个体化、微创化的最优质治疗。
　　3、消化道动力检查及胃肠功能障碍性疾病的综合诊治：该科的胃肠动力检查室配备有国际先进的检查及治疗仪器，在国内著名胃肠动力专家姚树坤教授指导下，承担了多项国家级和省部级重大课题，对胃食管反流病、贲门失弛缓症、慢性便秘、肠易激综合征等动力相关疾病有丰富的诊疗经验。
　　4、内镜逆行胰胆管造影（ERCP）及治疗：胰胆学组针对胆总管结石、胰管结石、梗阻性黄疸、胰胆肿瘤进行诊断治疗，与以往开腹手术比较具有并发症少、创伤小、费用低等优点，且疗效确切。
　　5、慢性肝病的中西医结合综合治疗：慢性肝病在我国有较高的发病率和患病率，尤其是病毒性肝病、酒精性肝病和脂肪性肝病发病率不断增长，已成为严重影响人民健康的一类常见多发病。慢性肝病的个体化和综合治疗是该科的主要研究和诊治方向之一，肝病学组在北京市中西医结合肝病学会主任委员姚树坤教授的带领下，着重强调以中西医结合为特色，明显改善预后，提高生活质量。
　　6、消化道狭窄扩张、支架治疗：包括由良、恶性疾病引起的食管、幽门、胰胆管等狭窄。通过扩张及支架置入治疗可减轻梗阻，恢复正常生理功能，尤其适用于无法进行手术治疗的病人。
　　7、上消化道出血及食管胃底静脉曲张硬化和套扎治疗：上消化道出血是肝硬化的严重并发症，也是肝硬化最常见的死亡原因之一，病情凶险，病人往往在第一时间得不到有效的治疗。该科在国内率先开展并推广了内镜下食管胃底静脉曲张硬化套扎治疗，效果良好。
　　8、胃食管反流病（GERD）：主要症状有反酸、烧心、嗳气、胸骨后疼痛、吞咽时胸痛等，常被误诊为冠心病、哮喘等疾病。通过胃镜、食管Ph测定、食管测压等方法明确诊断，并能掌握每个患者发病特点及规律，成立了专病门诊，开展个体化治疗，效果显著。
　　9、胶囊内镜及小肠镜：小肠疾病曾是消化内科的诊治难点，随着新技术、新方法的发展，这一方面取得了巨大突破。该科是国内较早引进胶囊内镜检查和小肠镜诊治的医院之一，具有较高的技术水平，提高了小肠疾病的诊治及预后。