神经科是该院知名专业。在医、教、研等方面拥有很强的综合实力，临床与科研的有机结合使神经内科在对神经系统疾病的病因学研究、诊断和综合治疗等方面取得了出色的成绩，并在运动障碍与神经遗传疾病、脑血管病、癫痫、神经肌肉病、神经免疫病、认知障碍与痴呆、前庭功能障碍、神经视觉障碍、睡眠障碍多个专业领域开展了深入的临床与研究工作，具备先进的实验检测设备和技术，形成了神经内科特有的医疗特色。科室年门诊量达10万余人次，床位数51张。
　　神经内科主任焦劲松教授，首席医疗专家王国相教授，长期从事神经内科临床工作，在神经内科领域拥有很高的学术地位和影响力，主持及参与完成多项国家自然科学基金课题和卫生部科研基金项目。王国相教授任中华神经病学会委员、北京市神经病学分会委员和国际MJD研究会委员。医师队伍中，高级职称占47.06%；硕士以上学历者占89.7%。
　　神经内科承担卫生部部属（管）医院临床学科重点项目，参与、完成多项科技部、教育部及厅局级课题、国家自然科学基金课题、北京市自然科学基金、十五国家科技攻关课题和首都医学发展基金课题等。卫生部科研基金项目“中国Machado－Joseph病的临床病理和分子生物学研究”获得卫生部科技进步一等奖和国家科技进步二等奖。在国内外具有影响力的刊物上发表了大量医学论文，其中SCI收录著论5篇，其中1篇发表在国际顶级神经病学杂志（annals of neurology，IF10.7）。
　　医疗特色
　　1.运动障碍与神经遗传病：已形成专病门诊－专业的临床实验室－相关基础研究的一条龙模式，成立了“运动障碍与神经遗传病研究中心”，开展多种神经遗传病基因检测及相关研究，并采用中西医结合方法进行对症治疗和神经保护治疗。迄今共承担国家自然科学基金面上项目和卫生部临床学科重点项目等7项国家级和卫生部科研基金项目，在国内神经内科界具有很高的声誉。专病门诊：周四下午。
　　2.脑血管病：在国内最早开展rtPA静脉内和动脉内溶栓治疗，流程严谨，安全性高，与神经外科合作开展介入诊断和治疗，显著改善了脑卒中患者的预后，并承担了国家的“九五、十五”脑血管病介入治疗攻关课题。在血管超声诊断方面，采用TCD和颈动脉彩超开展血管狭窄，栓子监测等检查，为脑血管病的诊断和治疗提供了有力的依据。开辟了急性脑血管病抢救治疗绿色通道，专业化卒中小组对患者进行全面评价，给予统一规范、个体化的治疗。专病门诊：周一、周二、周三下午。
　　3.癫痫和发作性疾病：针对儿童和成人患者，致力于各种类型癫痫的正确和准确诊断，进行规范化、个体化治疗，同时与神经外科和儿科专业医生共同协作，针对顽固性病例，综合运用包括内科和外科手术以及即将开展的微创治疗手段，争取最佳的临床效果，最小的不良反应。在基础研究方面重视对癫痫的遗传学和发病机制的研究，并引进和探索新的诊断和治疗方法。专病门诊：周三下午。
　　4.神经肌病：致力于周围神经和肌肉病的诊断与治疗。在神经肌电生理方面具有完备的检测基础，对各种周围神经病、肌肉病变、神经肌接头病变的电生理诊断有深入的研究。在神经病理方面与该院临研所中心实验室和电镜室合作，独立开展周围神经和肌肉病理诊断。同时与该科神经遗传病专业组合作开展线粒体病等疾病研究。专病门诊：周二下午.
　　5.认知障碍与痴呆：主要从事中老年认知障碍和行为障碍的临床诊治工作，包括轻度认知功能障碍、老年性痴呆（阿尔茨海默病）、血管性痴呆及其它神经系统变性病的记忆障碍，开展多项神经心理学测查、脑电图、事件相关诱发电位等检测项目，可为患者提供中西医结合治疗方案及康复训练的指导。专病门诊：周四下午。
　　6.神经免疫病：具有多年神经免疫病临床诊治经验，建立了完善的诊断、评估和治疗体系，可进行相关的全面、权威的辅助检查，较早开展了血浆置换、丙种球蛋白注射、β-干扰素和各种免疫抑制剂治疗，与该院血液净化中心、胸外科和肿瘤放疗科合作，为重症肌无力、吉兰-巴雷综合征和多发性硬化等患者进行血浆置换、免疫吸附或胸腺的手术和放射治疗。专病门诊：周二下午。
　　7.睡眠障碍：开展相关临床电生理检测，对不同原因导致的失眠，睡眠行为障碍、发作性睡病等进行及时准确的诊断和科学的治疗。专病门诊：周一下午。
　　8.头晕：依托最新的四通道红外线视频眼震电图，甄别各种中枢和外周的头晕并进行相应的对症治疗。专病门诊：周二下午（暂停诊）。
　　9.神经性视觉障碍：分析和诊断引起视觉障碍和眼部异常的神经疾病，并通过专业的神经治疗改善视觉功能，提高患者的生活质量。专病门诊：周四下午。