华西医院血液科始建于50年代，至今已有近50年的历史。下设两个病区共100张病床；一个拥有9张开放床位的100级层流病房，供开展造血干细胞移植用；所属血液病专业实验室是医院教育部人类疾病生物治疗重点实验室组成之一。华西医院血液科为博士、硕士研究生培养点，亦是血液专科医师进修学习的基地，每年接收省内外专科进修医师12～20人。血液科目前已形成红细胞疾病、白细胞疾病、干细胞移植、出凝血疾病四个学科方向。对多种常见和疑难血液疾病的诊治，尤其在白血病、出凝血性疾病的诊治上有明显优势。在大力开展自体骨髓移植的基础上，1994年成功地开展了西南首例异基因骨髓移植，1997年又在西南地区首家成功开展异基因外周血造血干细胞移植；1999年在西南地区首次成功进行了无血缘关系供者的异基因骨髓移植，供者全部来自于台湾花莲慈济自愿骨髓捐赠中心；2000年3月，西南地区首例同胞异基因脐血干细胞移植获得成功；2000年10月采用非骨髓去除性造血干细胞移植技术治疗骨髓增生异常综合征再次获得成功。异基因造血干细胞移植患者长期无病生存达70%，干细胞移植技术在西南地区处于领先地位。

　　华西医院血液科现有医师、护士及医技人员共60人。各级医师23人，其中教授7人、副教授4人、主治医师8人、住院医师4人。全国血液病学会委员、学组成员3人，省、市级学术机构主任委员2人，副主任委员2人，委员5人。国际性杂志“Leukemia”中国编委1人，中华医学系列杂志编委1人，其他全国性医学杂志编委4人。主治医师以上中青年医师均经过硕士或博士研究生培养，科室副高以上中年业务骨干均曾留学美、加、日等国，他们在医疗、教学、科研中起到了重要作用。