辽宁医学院附属第三医院病理科始建于1958年，20世纪70年代起成为铁道部病理诊断培训基地，1986年被命名为铁道部病理技术中心和沈阳铁路局病理技术中心，2004年成为辽宁医学院病理教学基地，为医院重点专科。五十多年来，圆满完成组织病理学、细胞病理学、尸体解剖检查及疑难病例会诊任务和病理学研究生、本科生及进修生教学培养任务。

    病理科建筑面积五百平方米，科内设立有病理诊断实验室、分子病理实验室、免疫组化实验室、细胞病理室实验室、免疫荧光实验室和病理标本陈列室等。拥有辽西地区唯一的全自动组织病理检测系统和数码显微镜;拥有全封闭智能组织脱水机、全自动石蜡包埋机、电控进样轮转切片机和冰冻切片机、全自动染色盖片工作站、包埋盒打码机、载玻片打码机、全自动液基超薄细胞制片系统及荧光生物显微镜、显微图象诊断分析系统等全新进口病理设备。病理科业务流程实现网络化信息管理。

    病理科拥有具有实力的诊断、教学和科研队伍，包括硕士研究生导师、教授、主任医师等高级病理专业人员，研究领域涵盖胃肠道间质瘤、甲状腺癌、膀胱癌、前列腺癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌和肺癌等肿瘤病理学研究，研究成果多次获得省、市级奖励，在《中华病理学杂志》、《中华肿瘤学杂志》、《中华内科学杂志》、《国际病毒学杂志》等期刊发表学术论文六十余篇。