西苑医院肛肠科，是一个有着六十多年历史，在国内享有盛誉，中医特色和优势都非常显著的优秀专科，是中国医师协会中西医结合医师分会肛肠专家委员会主任委员单位、北京肛肠学会会长单位、中国中医药信息协会肛肠分会会长单位，北京市中医药管理局重点专科建设单位。诊治范围包括各类肛肠疑难疾病，特别是在结肠癌、直肠癌、复杂肛瘘、高位肛周脓肿、嵌顿痔、直肠脱垂、慢性顽固性便秘、血液病合并肛肠疾病、术后并发症治疗等方面具有显著优势。接受来自全国各地的肛肠疑难疾病转诊。
　　西苑医院肛肠科现有主任医师3名、副主任医师3名、主治医师4名，其中博士4人、硕士4人、学士2人。拥有住院床位33张, 年住院病人及手术例数均超过1600例。病房设施完善，开设有治疗室、换药室、处置室、监护室、中医综合治疗室、肠镜检查室等。配置有电子乙状结肠镜、肛管直肠测压仪、生物反馈治疗仪、肛管直肠腔内治疗仪、结肠水疗治疗仪、红外线治疗仪、频谱治疗仪、直肠腔内超声仪、中药熏洗机、中药离子导入仪、艾灸治疗仪等。广泛开展具有中医、中西医结合特色的诊疗服务项目，如高悬低切术治疗混合痔、中医微创术式铜离子电化学疗法（ECTCI）治疗内痔、中药硬化剂注射治疗内痔、直肠瘢痕支持固定术加中药硬化剂注射术治疗出口梗阻型便秘、内口切开对口引流术式治疗高位复杂性肛瘘、一次性根治术治疗肛周脓肿、穴位强化埋线治疗顽固性便秘等，此外还开展结肠次全切除治疗慢传输型便秘、PPH/TST/RPH技术治疗重度混合痔、腹腔镜双吻合器技术治疗低位直肠癌、STAPRE手术治疗直肠脱垂、经肛门直肠肿瘤切除手术等。