内蒙古医学院第二附属医院小儿骨科承担着内蒙古医学院在该领域的医疗、教学、科研任务，为学院硕士培养、授予点之一，也是内蒙古自治区惟一一家独立诊治小儿骨和关节疾病的小儿临床科室，自治区小儿麻痹矫形治疗中心就下设于本科室。于1985年成立至今20多年来，积累了近8000例手术经验，并且成为自治区最早成立的小儿骨科医、教、研基地。目前小儿骨科开放病床34张，门诊量约3500人次╱年，急诊约300人╱年，手术约600例╱年，出入院700多例╱年，拥有医护人员18名，其中主任医师(教授)1名，副主任医师(副教授)1名，主治医师(讲师)1名，住院医师1名，尚有本院轮转医生、研究生和进修医师数名。小儿骨科在医院不断发展壮大下也日益成熟和完善起来，并且成为了内蒙古医学院第二附属医院的重点科室和品牌科室。