重庆医科大学附属儿童医院呼吸专业及其病房成立于20世纪80年代初， 是医院最早成立的专业及独立病房之一。1992年成为重庆市唯一的“儿童哮喘防治中心”，2005年成为重庆医科大学“儿童过敏性疾病诊治中心”，2007年成立重庆医科大学附属儿童医院呼吸中心，2008年成为重庆市医学专业重点学科，2010年成为国家药监局儿童药物临床试验基地之一，2011年成为国家级临床重点专科。荣获重庆市青年文明号光荣称号（2000年）、重庆市教科文卫体工会授予的“五一巾帼标兵岗”称号（2012年）、中华全国总工会授予的“五一巾帼标兵岗”称号（2017年）。经过几代人的共同努力，重庆医科大学附属儿童医院呼吸专业学科已经发展成为拥有三个病房（床位160张）、哮喘专科及特需服务门诊、儿童肺功能室、儿童支气管镜室、儿童睡眠功能监测室、儿童呼吸病研究室等集临床、教学、科研与培训为一体，整体实力全国领先的儿童呼吸系统疾病诊疗中心。呼吸中心周一至周日开放哮喘专科门诊及特需服务，年专科门诊量逾2万人次，年收治住院病人约7000人，平均住院日6.30天左右，临床专科服务辐射至四川、云南、贵州、陕西、湖北、新疆等中西部地区，以及大重庆所辖所有区县及其他省市，住院外埠病人比例达25%，疑难危重病人抢救成功率达90%以上。先后获得国家级课题13项，省部级课题10项，科研经费逾500万元、重庆市卫生局重点学科建设经费100万元，医院配套重点专科及实验室建设经费200余万元，发表学术文章200余篇，SCI文章20余篇，获得省部级/厅局级科技进步奖13项。积极参与著作与教材的编写，主编科学出版社出版的《疾病学基础》，参编高等教育出版社出版的《儿科学》教材、北京大学医学出版社出版的《社区儿童哮喘病例管理》、人民军医出版社出版的《儿科疾病用药备忘录》、人民卫生出版社出版的《儿科常见病用药》。
　　【呼吸专科人员构成与人才梯队建设】
　　呼吸专业组共有成员127名，包括：医师42名，护士78名，技术人员7名。正高职称人员6名，副高职称人员4名，中级职称人员18名。博士13名、硕士25名。博士研究生导师2名，硕士研究生导师9名，指导毕业硕士研究生100余名、博士研究生20名。承担研究生、七年制、本科与留学生教学，教学效果优良。11人在国家级及省市级学术机构中担任学术职务。
　　【呼吸专科诊治疾病种类与特色检查】
　　主要诊治疾病包括：各种社区获得性肺炎、院内获得性肺炎、支气管哮喘、毛细支气管炎、气管支气管软化狭窄、原发性肺结核、肺脓肿、迁延性肺炎、慢性肺炎、闭塞性毛细支气管炎、肺血管畸形、气管-支气管异物、特发性肺含铁血黄素沉着症、支气管扩张、弥漫间质性肺疾病、免疫缺陷病肺部并发症、系统性血管炎肺部侵害等疾病，其中：重症难治性肺炎、难治性喘息性疾病、慢性咳嗽病因诊断与治疗居全国领先水平。建立与国际接轨的支气管哮喘规范化诊断、治疗、长期随访管理。
　　常规开展的临床技术项目包括：多种过敏原皮肤点刺与血清过敏原检测及标准化特异性免疫治疗、氧疗、空气压缩雾化吸入治疗、壁挂式吸痰、震动排痰、血气分析测定、胸腔穿刺、肺功能（基础、舒张试验、激发试验、脉冲震荡）、支气管镜技术、肺CT检查、胸腔镜肺活检等。在特色技术方面：近5年共完成儿童纤维支气管镜术上千例；婴幼儿/儿童基础肺功能测定、激发试验、舒张试验13万人次；肺CT（平扫、高分辨、增强、气道重建、血管重建）7千余人次。
　　依托临床检验中心、分子医学中心及儿童呼吸病学实验室开展包括新发偏肺病毒、人类博卡病毒等十余种病毒病原、细菌病原培养与耐药监测、肺炎支原体、衣原体等多种病原检测，呼吸道病原学检测水平居国内领先。近年还开展了呼吸系统疑难疾病基因诊断。