重庆医科大学附属儿童医院泌尿外科成立于1973年，是国内最早成立的儿童泌尿外科专科之一。2001年成立重庆医科大学儿童泌尿生殖疾病中心。重庆市医学重点学科，是培养全国各地小儿泌尿专科医师的重要基地。拥有诊治儿童泌尿外科疾病的全国知名专家，包括教授4名，副教授2名，讲师6名；海归学者5名（美国、德国、英国、香港高级访问学者或博士后学习培训），博士后1名。其中，博士10名，硕士2名，基本实现年轻队伍博士化。是中华医学会小儿外科学分会副主任委员及青年委员、中华小儿外科学分会泌尿外科学组顾问及委员、重庆市医学会小儿外科专委会主任委员及委员单位，全国高等学校教材《小儿外科学》编者单位，《中华小儿外科杂志》、《临床小儿外科杂志》等常务编委及副主编单位。目前，该学科在综合实力，尤其在临床应用转化、基础研究、研究生培养等方面已经位居全国前列。
　　常年开放床位52张；开设全国知名专家门诊及专家专科门诊，每天均接诊泌尿专科病人。每年诊治专科病人逾万人次（病人来自包括重庆、四川、贵州、云南、西藏、广西、湖北、广东、海南、河南、北京、山东、浙江等全国20多个省市）。
　　二、临床工作
　　该中心具有丰富、成功的临床经验，其疾病诊治水平已达到国内先进或领先水平。
1.先天性尿道下裂：
尿道下裂不但多见，而且其发病率尚有不断增加趋势。该病目前术式甚多， 并发症甚多，其并发症国外报告至今仍高达20%左右，中心在近5年所诊治的2000余例中，一期术后尿道正位开口、形态满意、排尿通畅无漏尿者已达到85%以上。特别对重型尿道下裂有丰富的临床诊治经验。
　　2.先天性肾积水：
对各种原因所致的肾积水均有丰富的临床诊治经验，特别是对常见的肾盂输尿管连接处梗阻所致肾积水，目前报告肾切除率仍在10%左右。本中心均能成功保留病肾。并在腹腔镜下完成微创手术，达到快速康复。
　　3.肾母细胞瘤：
肾母细胞瘤是儿童泌尿生殖系统最常见肿瘤。由于该中心加强了对晚期病人术前和术后的规范性化疗，术中根治性切除肿瘤，无瘤存活率已达到90%以上，达到国际先进水平。近10年中，成功治愈5例双侧肾母细胞瘤。
　　4.阴茎先天性畸形：
表现为阴茎短小的埋藏阴茎，蹼状阴茎、小阴茎临床并不少见，治疗方法尚不规范。该中心自行设计了治疗埋藏阴茎的手术方法，取得了非常满意的效果，已在国内广泛推广应用。
　　5.腔镜微创技术：
该中心的腔镜微创技术已达全国领先水平。已成熟开展的腹腔镜下治疗肾积水，气膀胱下腔镜输尿管膀胱再植等技术达到国际先进水平。常规开展腹腔镜下治疗隐睾、精索静脉曲张、肾发育不良及重复肾、上尿路结石、后尿道畸形等手术治疗。选择性开展了肾上腺肿瘤、神经母细胞瘤、膀胱肿瘤等切除手术。手术创伤小，恢复快，并发症少，疗效确切。
　　6.儿童排尿功能障碍：
尿失禁、遗尿症、尿频、排尿困难等，系常见但又未受到足够重视的疾病，该中心为解除患儿及家属的烦恼，购入了先进的尿动力学检测设备，对其病因进行研究，同时进行有效的治疗。
　　7.小儿泌尿外科常见病 如隐睾，鞘膜积液，膀胱输尿管返流，泌尿系统损伤等治疗方法成熟、先进，疗效好。
　　8.小儿泌尿外科少见病及复杂畸形 如肾上腺、膀胱肿瘤，两性畸形，膀胱外翻、尿道上裂，神经原性膀胱等，均有丰富、成功的治疗经验。
　　三、科研工作
该中心对儿童泌尿生殖疾病进行了广泛深入的研究，科研主攻方向为儿童泌尿生殖系统先天性畸形发病机制研究。主持“国家十一五科技支撑计划”子项目1项、国家自然科学基金16项、教育部重点项目、重庆市科委、卫生局、教委等科研基金资助项目20余项。获得科技部/宋庆龄儿科医学成果奖1项，中华医学奖三等奖1项，教育部科学技术进步奖二等奖1项，市级成果奖3项。近5年发表论文150余篇，其中SCI30余篇，CSCD100余篇。获得国家专利12项。研究成果在国内外学术会议上交流，受到了国内外学者的重视和认可。
　　通过对儿童鞘膜积液病理解剖学的研究，将过去常规的鞘膜外翻术改为了鞘突高位结扎术，且在全国范围内得到了广泛的推广和应用。通过对高位精索松解在隐睾手术中的意义的研究，探讨出了隐睾的最佳手术方式，提高了隐睾满意的复位率，减少了术后睾丸的萎缩。通过对一侧睾丸损害导致对侧睾丸代偿性肥大的研究，提出了睾丸代偿性肥大有可能影响其后生育力的见解。目前正在进行尿道下裂病因及发病机制研究，肿瘤化疗药物对生精功能的损害及保护机理的研究。通过众多的基础及临床研究，不但提高了该中心的基础理论水平，也为提高临床治疗水平奠定了坚实的基础。