广州医学院第二附属医院感染病科(原名传染病科)建立于1984年，是一个医疗、教学和科研全面发展的综合性临床科室。20多年来，在院党委的正确领导及科主任的带领下，依靠全体医护人员的积极努力，在医疗、教学和科研方面取得了较好成绩，使学科在感染性疾病的诊断和治疗水平上均走在同类医院科室的前列。感染病科现有32张病床的住院病房和传染病普通门诊、肝炎专科门诊及肠道病专科门诊、发热门诊(门诊每天接诊病人100人以上)。同时也兼为广州医学院第二临床学院传染病学教研室，承担广州医学院临床医学、影像学、麻醉、预防等专业专科、本科、硕士研究生的传染病学、临床医学概论的理论、见习和实习的教学。

现有医务人员28人，其中教授、主任医师2人、硕士导师1人、副主任医师6人，主治医师和主管护师12人，护师和护士8人。