深圳市第二人民医院的前身是00049部队医院，建于1982年，于1983年9月更名为基建工程兵职工医院。1984年12月，经深圳市编委批准转为地方医院，1995年1月改名为“深圳市华强医院”。1987年10月，经深圳市政府批准，与原深圳市红会医院门诊部合并更名为“深圳市红十字会医院”，2001年7月再次更名为深圳市第二人民医院。
全院现有职员2000多人，其中正高职称103人，副高职称390人，博士后10名，博士64名，硕士172名，拥有当今世界上最先进的核磁共振成像仪、数字减影血管造影机、螺旋CT、彩色超声、电子内镜、超声内镜、全自动生化分析仪等一大批高新技术设备。现开放床位1008张，设：30个病区、55个专业科室。
目前医院已有省市重点专科9个，是深圳市拥有最多重点专科的医疗单位。其中市级重点专科8个，占全市个中的15.09%，外科整体优势尤其明显，占了5个。血液科为广东省特色专科，中西医结合老年病科为广东省中医药管理局重点专科建设单位，血液科、神经外科、烧伤整形科、肝胆外科、脊柱外科、内分泌科、创伤骨科、超声科、中西医结合老年病科等为深圳市重点专科。创伤外科、消化内镜、甲状腺乳腺专科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、康复医学科、中西医结合科、体检中心等都是医院的特色专科。目前，医院已形成以急救医学为龙头，重点专科为特色，内、外、妇、儿全面发展、医教研协调并进的新格局。
内镜技术因其创伤小、恢复快，现已成为外科手术的首选治疗方式。为了更好的为深圳市民服务，增强深圳市的整体医疗水平，填补深圳内镜基地缺失的空白，我院2006年骨科及肝胆外科成功通过了“骨关节内镜基地”和“腹腔镜内镜基地”的初评，这两个基地是深圳市仅有两个通过全国内镜基地初评的的建设科室。
作为南方医科大学非直属附属医院我院依托南方医科大学强大的科教研实力，在医学人才培养、学科建设、医疗和科技发展、教学管理、师资培训、医疗技术、科学研究和对外交流等方面发挥了巨大的促进作。
医院全体职员在院领导的带领下，以饱满的精神面貌、优质的医疗质量、高尚的医德医力争把医院建设成为广大市民信赖的医院、放心的医院、首选的医院、成为人民群众满意的健康家园。
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