妇瘤科成立于1987年，是西北地区最早建立的集手术、放疗、化疗等综合治疗于一体的妇科肿瘤专科。现开设3个病区，96张床位，有副高以上专业技术人员9人，博士1人，硕士8人，配备后装放射治疗机、腔内治疗计划系统、Leep刀、阴道镜等先进诊疗设备。医院宫腔镜治疗中心设在该科。

妇科肿瘤规范化综合治疗是其突出特色，科室充分利用手术、放化疗等治疗手段，形成了一整套妇科肿瘤诊治规范。开展了“卵巢癌腹主动脉旁淋巴结清扫术”、“卵巢癌转移脏器切除术”、“外阴癌巨大肿瘤根治术及转移皮瓣成形术”等大型复杂手术， “卵巢自体移植及移位手术”、“早期宫颈癌保留子宫根治术”、“阴式子宫切除术”、“阴式肌瘤剔除术”等新型术式，还开展了各类妇科肿瘤的根治性放射治疗、腔内放疗、肿瘤插植、敷贴式局部放疗、适形放疗、化疗等技术。

先后开展了略阳、镇安、绥德县等宫颈癌高发区早诊早治工作。承担省级科研项目10项，其中3项获奖，主编《现代妇科肿瘤》专著。被陕西省卫生厅确立为陕西省妇科肿瘤诊疗中心、陕西省优势学科，是陕西省医学会妇科肿瘤分会主委单位。