肝胆胰外科是我院重点学科，自2002年以来已连续二届获得区特色专科。其中腹腔镜胆囊切除术、十二指肠镜和胆道镜技术已成为区内的领先与优势项目，是区里唯一能够开展三镜联合应用诊治肝胆胰疾病的医院。腹腔镜胆囊切除术数量居区内首位。此外肝癌半肝切除术、肝内胆管结石肝部分切除术、肝门区肝管空肠吻合术、先天性胆总管囊肿切除术、壶腹部周围癌胰十二指肠切除术、门脉高压症巨脾切除及断流等手术，在区内也处于领先水平。中西医结合及手术治疗急性重症胰腺炎也积累了较丰富的临床经验，治愈率达90%以上。

科室人才梯队合理，技术力量雄厚。目前拥有主任医师2人（其中1人为硕士研究生导师）、副主任医师3人、主治医师3人。科室拥有进口的腹腔镜、胆道镜、十二指肠镜等先进设备，为肝胆胰疾病的诊治提供了可靠保证。

近年来全科共在《中华普通外科杂志》、《中华肝胆外科杂志》、《中华消化内镜杂志》《肝胆胰外科杂志》等中华级、省级医学杂志发表论文10余篇。另有多项课题已列为金山区或六院联合体科研项目。