新华医院新生儿科由我国儿科著名老前辈冯树模和吴圣楣等教授在1970年代初创建，几十年来在他们的带领下得到不断发展，2008年正式成为独立科室，目前为教育部“211工程”重点学科，在全国和上海具有重要的地位和影响。多年来是中华医学会儿科学会新生儿学组和中华医学会全国围产学会等学术组织的成员单位，著名新生儿专家朱建幸教授目前为中华医学会全国围产学会常委、上海医学会围产学会副主任委员，上海医学会儿科分会新生儿学组副组长，《中国新生儿杂志》副总编。新生儿科目前在朱建幸主任的带领下，已经成为医院临床医疗、教学和科研全面发展的重点学科。

新生儿科现有比较充实的学科梯队，其中教授和主任医师 5名，副教授和副主任医师5名和中级职务医师数名。现有博士生导师3名，硕士生导师3名，其中具有博士学位的5人，硕士学位的6人;有6名医师具有在北美、欧洲和日本等发达国家的医院和研究机构一年以上的学习培训经历。

新生儿科目前已逐步形成了新生儿学中的各亚专业，包括新生儿呼吸急救、新生儿营养、新生儿感染、新生儿免疫和新生儿神经等。是国内率先开设新生儿重症监护室的单位之一，在国内率先使用呼吸机救治重危新生儿，目前具有应用国内外最先进诊治技术的能力;年收治病人约1000余人;拥有各种高级多功能常频和高频呼吸器，一氧化氮吸入治疗仪、高级辐射暖床和暖箱、床旁血气监测仪、24小时脑电监测仪，床旁头颅B超和CRRT等设备，收治新生儿和服务范围涉及上海市各个区县和长三角地区。

新生儿科在上海市儿科研究所拥有新生儿/围产、新生儿营养和消化、新生儿免疫等研究室、并且和遗传和代谢疾病研究室、新生儿听力筛查中心、小儿营养中心等紧密合作，在危重新生儿急救、危重新生儿整体监护(包括围手术期生命支持)、新生儿颅内病变的诊治、新生儿脑发育的评估和干预、新生儿免疫学、新生儿感染的防治、新生儿临床流行病学、新生儿营养学、新生儿遗传和代谢疾病的诊治、新生儿听力筛查等重点领域，先后完成过国家“七五”“八五”和“九五”的科技攻关项目、国家自然科学基金和上海市科委、教委等课题，先后获得国家、卫生部和上海市的科技成果奖项十余项。目前承担国家自然科学基金3项，市科委等课题数项，研究方向涉及新生儿呼吸衰竭的救治、新生儿颅内病变和脑发育的干预(早产儿脑室周围白质软化的防治、新生儿脑发育的研究、新生儿缺氧缺血性脑损伤的保护性治疗)，新生儿免疫(感染免疫、新生儿免疫治疗、新生儿营养免疫和新生儿免疫脱敏的研究)。近5年发表专著、教科书10余部和中英文论文120余篇。