福建医科大学附属第一医院病理科是一个研究型的综合性科室，集病理诊断、教学、科研为一体，为该院重点学科之一，技术力量雄厚，整体学术水平高，仪器设备先进。病理科设在医院病房大楼的十二层，年常规病理诊断量达4万多例，细胞病理诊断量3万多例。建有病理学硕士点，先后培养硕士研究生27人。科室专业人才济济，现有教授、主任医师、副主任医师4人，中级职称10人，初级职称人员15人；其中硕士以上学历的医师13人，硕士以上学历的技术人员2人。学科发展迅速，已经设置有病理学亚专业的分科，如淋巴造血系统疾病病理、软组织肿瘤病理、中枢神经疾病病理、乳腺及女性生殖系统疾病病理、骨关节疾病病理、肾脏疾病病理、皮肤病理、肝脏病理、液基细胞病理和分子病理等。
　　科室装备有国际一流的医疗设备，包括美国Thermo系列病理设备如全自动密闭式脱水机、全自动恒冷切片机、组织包埋中心、等，德国Leica系列病理设备如3050全自动恒冷切片机、全自动染色仪和盖片仪和2245轮转式石蜡切片机等，意大利Milestone超速微波组织处理仪，全自动免疫组化染色仪，美国THIN PREP液基薄层细胞处理仪，美国FORMA二氧化碳培养箱，日本Olympus BX61荧光显微镜、IX70倒置相差显微镜，Olympus十人共览教学显微镜，图文PACS系统，美国Eppendorf梯度PCR仪，荧光原位杂交分析系统，全科从住院医师至主任均配备Olympus BX51显微镜。建有荧光显微观察室进行肾脏穿刺活检、皮肤、肝脏活检免疫荧光分析及荧光原位杂交基因分析，免疫组化染色工作室，特殊染色工作室，细胞培养室，液基细胞诊断工作室，分子病理实验室进行基因表达和突变、SNPs检测及基因组测序等工作，全院PACS图文系统工作站和远程病理工作站。
　　病理科科学研究基础扎实，成绩显著，近5年来获国家自然基金、卫生部及省级等多项课题资助，在国内外核心期刊发表科研论文40多篇，其中SCI收录10篇。参编学术专著5部，主持科普著作翻译12册。获省科技进步奖四项。病理科学术活动活跃，注重与国际接轨，多次举办全国性、地区性会议和国家级学习班，邀请国内外知名病理学专家进行学术讲座，积极参与国际性学术会议，常年担任基层医院病理科医生的进修培训工作，先后培训省内外（包括新疆）病理医师60多人。