蚌埠医学院第三附属医院泌尿外科是本地区较早建立的泌尿专科之一。泌尿外科一直是宿州地区泌尿外科疾病和肾脏移植的医疗、科研、教学中心，在本专业领域的疑难危重症的诊断救治上，积累了丰富的临床经验。多年来，全科医务人员积极钻研业务，不断创新，有许多新技术填补了宿州地区泌尿外科专科医疗领域的空白。2001年在宿州地区率先开展的经尿道前列腺(汽化)电切手术，多年来共完成三百余例，无一例出现意外或严重并发症，疗效确切，并发症降低到了最低程度，是省内开展该项技术最为成熟的专科。2002年，在省内率先开展输尿管镜气压弹道碎石术，由于其创伤小、恢复快、无痛苦，住院时间短，深受到病人欢迎。

　　微创泌尿外科：始于2000年，是宿州地区开展经尿道手术最早的医院之一。至今，成功实施各类腔道手术千余例，积累了丰富的临床经验。临床研究在省内居领先水平，其中经尿道前列腺切除和输尿管镜气压弹道碎石的临床效果达到国内知名医院的水平。泌尿外科腹腔镜治疗已开展精索静脉曲张高位结扎术、肾囊肿去顶术、乳糜尿肾周淋巴管结扎术、肾盂切开取石术等手术并取得了良好效果。