呼吸内科原称肺科，成立于1952年，由上海支援内地来到安徽的许学受教授创建，是医院最早获得硕士学位授予权的科室， 2002年度获得安徽医科大学校重点学科。目前科室拥有正高职称7人(50岁以下3人)，副高职称4人，中级职称2人;具有博士学位2人，硕士7人。主要学术带头人为博士研究生导师。已培养研究生36名。

本学科由3个专科病区、肺功能室、内窥镜室和200m2实验室组成。拥有多台呼吸机和监护仪，另有纤维支气管镜、胸腔镜、血气分析仪等。年专家门诊量2.5-2.8万人次，年出院1500病人次。科室为安徽省医教研的呼吸专业中心，拥有呼吸系统常见病种及各种疑难杂症，为临床教学和科研打下良好的基础。

多年来，科室出版专著18部，其中由许学受教授编著的《肺结核病》获得全国防痨协会优等奖和省科委一等奖;《肺科手册》再版四次，发行量近5万册;发表论文 600余篇。朱重远教授和庞玉英教授参与的《中国肺炎链球菌分型及其感染的研究》获卫生部1987年医药卫生科技进步三等奖;许学受教授负责研制的《XFY-A及XFY-B型多功能胸腹诊治仪》1993年获得省科技进步二等奖;刘丽华教授和张安成教授负责研制的《微型气胸自动诊疗仪》1990年3月获得国家实用新型专利;宋卫东主持研究的《运用支气管肺灌洗术探讨肺气虚证的客观实质》获1997年省科技进步三等奖;桂淑玉参与的《多肿瘤抑制基因在肿瘤细胞中缺失、突变的研究》获得2000年省自然科学三等奖。由许学受教授牵头创办的《临床肺科杂志》发行已达10年，于2000年获正式刊号。

许学受教授曾任第五、六、七届全国人大代表，1996--2001年任安徽省政协副主席。2003和2004年因防治“非典”工作突出，胡杰贵和孙耕耘获得安徽省五一劳动奖章，汪辉云分别获得安徽省和民进中央防治非典先进个人。胡杰贵被省三部委授予优秀共产党员。2005年孙耕耘获得全省卫生系统“十佳医生”称号。科室连续10年获医院先进集体称号。