心内科成立于1979年，2002年被确认为市级重点专科。该科技术力量雄厚，仪器设备精良,目前不仅能开展各种心脏病的常规治疗及单、双腔起搏器的安装，而且能够开展多种心脏疾病的介入治疗，居市内同级医院领先水平。该科视病人的需要为己任，始终坚持将社会效益放在第一位，2000年投入巨资引进技术新、功能优的射频消融治疗设备，成为苏北及苏中地区首家开展此一治疗项目的县级医院，并在市内县级医院中较早开展了介入封堵、动脉导管未闭、房间隔缺损、肺动脉瓣狭窄等多种先天性心脏病的介入治疗，成功率达97%以上，达省内先进水平。由于射频消融疗法科技含量高、创伤小、并发症低，且能达到彻底根治的效果，因而成为心动过速患者的首选治疗方法。2002年他们还成功地治疗了一名超重度先天性肺动脉瓣狭窄患儿，取得了满意的疗效。2005年,该科又成功开展冠状动脉造影和药物支架植入手术，使过去只能在省市级大医院才能完成的治疗技术成功在该院落户，极大地方便了病人。