是国家重点学科，成立于1952年，是我国规模最大的耳鼻喉学科之一，是教育部首批的硕士、博士授权点，临床医学博士后流动站，已故前辈胡懋廉、王鹏万、吴学愚教授等是我国耳鼻科事业的重要奠基者。现任学科主任王德辉教授，副主任李华伟教授、吴海涛主任医师和陈兵教授。医院耳鼻喉科是卫生部听觉医学重点实验室及耳鼻喉科药理基地和专科医师培训基地，是“211”、“985”工程一、二期重点建设学科项目。为首批上海市听觉医学领先专业、重点建设的临床医学中心之一(听觉医学中心)、上海市重点学科(头颈外科)。学科设有听觉言语疾病学科、耳神经颅底外科、头颈外科、鼻科及中西医结合鼻病中心、咽喉及小儿耳鼻喉科五个三级学科。学科现有中国科学院院士1名，长江学者特聘教授、国家杰出青年1名，市医学领军人物2名，博导11名，博士学位26名，博士后3名，形成了完整的学科梯队。自“十五”以来已经获得38项国家和省部级基金资助，发表论文440篇(其中SCI论文42篇)，授权发明专利7项，并获得国家级奖1项，省部级奖7项。耳鼻喉科正立足上海，面向全国，为建成亚洲一流的耳鼻咽喉科而努力。