连云港市第二人民医院前身为清光绪三十四年（1908年）基督教南长老会美籍传教士在海州开办的西医诊所，1913年美国实业家嘉尔翰的女儿爱伦丽芬临终捐资，在诊所的基础上正式兴建医院，并于1914年建成，定名为“义德医院”，此名一直沿用至解放前。新中国成立后，义德医院被政府接办，先后更名为新海连市立医院、海州医院、连云港市第一人民医院，1986年易名为连云港市第二人民医院至今。1996年连云港市第二人民医院被卫生部授予“二级甲等医院”，并增挂“连云港市肿瘤医院”院牌。
医院现有职工1018人，其中卫技人员856余人，高级技术职称人员151人。编制病床704张，设内、外、妇、儿、五官、肿瘤等20个病区。另设有手术室、检验科、放射科、药剂科等医技科室。医院设施先进，科室设置齐全，其中内肿瘤科、口腔科、分泌科为市首批临床重点专科，2004年肿瘤放疗科、内分泌科又被确定为市一类重点学科，口腔科、血液科、普通外科又被确定为市二类重点学科，另外，泌尿科、男性科、儿外科、妇产科、血液净化中心等在本地区享有一定声誉。
医院于1962年承担苏州医学院本科实习生实习任务，1963年承担徐州医学院本科实习生实习任务，并被确定为江苏省高等医学院校本、专科毕业生实习基地，1992年成为徐州医学院教学医院，并先后成为江苏大学、南京医科大学、省职工医科大学教学医院，每年带教高等医学院校本科实习生100余人。现教学设施不断完善充实，全院拥有教研室、示教室总面积337.23平方米，现代化教学器材和设备先进齐全，为全市各级医疗单位培养、输送了大批医疗技术骨干。2006年，经我院申请，安徽省蚌埠医学院报批，我院成为安徽省蚌埠医学院附属连云港医院。
医院服务范围覆盖苏北鲁南及连云港市周边地区，年门急诊量25万余人次，年住院病人超万人次，年业务收入超亿元。近年来，医院坚持以病人为中心，狠抓医疗质量的提高，并努力营造人才培养、引进的良好氛围。开展了体外循环下心脏直视手术、肾移植、冠状血管造影及扩张术、肿瘤碘-125粒子植入治疗、氩氦刀治疗肿瘤、适形及立体定向放疗、甲状腺碘-131治疗、心导管检查、永久性及临时性心脏起搏器安装、超声乳化治疗白内障、复杂青光眼治疗、眼部离子导入、滤光镜技术应用、新生儿围产期监测、脑肿瘤摘除、面颈部畸形矫正、颈动脉体瘤摘除、婴儿漏斗胸根治、二尖瓣球囊扩张术等技术，有大批新技术项目在连云港市均处于领先水平，其中有2项新技术获江苏省新技术引进奖二等奖，并且有20余项科研题通过了省市级科研鉴定。
医院现拥有十万元以上的大型医疗设备达100余台（件），瓦里安直线加速器1台、西门子直线加速器1台、核磁共振1台、螺旋CT2台、DSA1台、准分子激光治疗仪1台、流式细胞仪1台、体外循环机1台、血液净化系统4台、氩氦刀1台、粒子刀1台、适形及立体定向放疗系统3台、射频热疗仪1台、自动生化分析仪3台、多功能麻醉机10台，另有彩色多普勒超声诊断仪、动态心电图、经颅多普勒、尿沉渣检测仪、数字Ｘ光机、ECT等先进的医疗设备。配有中央空调、中心供氧、中心负压、外线直拨电话及全套卫生设施的综合病房大楼，是连云港市条件较好的病房之一。2000年投入使用的建筑面积达14300平方米的现代化门急诊综合大楼功能齐全、设施先进，为病人营造了良好的就医环境。目前，医院总资产已突破2.3亿元。
医院连年被评为省市级文明单位，三次被评为省文明医院，并被卫生部授予“全国卫生文明建设先进集体”称号，1995年８月通过了国家爱婴医院的评估验收，并被卫生部授予“二级甲等医院”，1997年医院跨入“无红包医院”行列，并被有关部门授予市直卫生系统惟一的“园林式绿化先进单位”和连云港市首届十佳文明服务窗口”。
位于市中心位置的原江苏省盐务局总医院，占地面积42000多平方米，紧扼连云港市的东南大门，具有良好的发展前景。经省市两级政府批复将该院正式划交市二院，成为连云港市第二人民医院东院区，投资1.5亿元人民币，总面积达7.2万多平方米的门急诊楼和病房楼不久将投入使用，届时床位将达到600余张，全部为双人间的高档病房。这样我院将成为共拥有1106余张床位、1500余位职工并以东院区的“大综合、小专科”和西院区的“小综合、大专科”为特色的功能齐全、设施先进的现代化医院。
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