北京儿童医院急诊科的前身与儿童重症监护室(PICU）共同组成急救中心，成立于1983年，是国内最早成立的急救中心之一。自建以来，即受卫生部、联合国儿童基金会(UNICEF) 委托，成为我国儿科急危重专业人员的培训基地，并与意大利、美国、新加坡和香港等国家和地区的儿科专业保持交流。2010年急救中心成为国家卫生计生委国家级临床重点专科。
为更好的开展医疗工作，符合专科专业化发展趋势，儿科急诊科于2012年8月正式组建，成为独立的一级科室，承担各种儿童急危重症的抢救和治疗工作。集医疗、教学、科研为一体，在全国儿科急诊中居于首位。
　　急诊科由急诊内科、急诊外科、急诊留观、急诊手术室组成，并即将耗资千万元组建急诊EICU 。每年接诊来自北京市和全国各省市的患儿超过20万人次，每年抢救急危重症患儿超过2万人次，抢救成功率达99%以上。急诊外科每年诊治6万5千余人次，清创缝合7千多人次，急诊病房手术1千多例。
急诊科收治范围包括各种小儿内科、外科危重症和疑难重症，中毒、溺水、车 祸等意外伤害。在心肺脑复苏、严重感染、各种儿科慢性疾病急症危象、儿童中毒与意外伤害等方面技术上水平居全国首位。在国内儿科急诊科率先开展了有创和无创机械通气、骨髓输液及呼吸功能监测、无创和有创血流动力学监测、经颅多谱勒超声监测、床边心脏及胸腹B超监测等实用急诊抢救监护技术。对呼吸衰竭、休克、多脏器功能衰竭患儿的抢救成功率居国内领先水平，综合医疗、科研水平在国内居领先地位，有些项目已接近或达到国际水平。