感染病科成立于1978年，是县内唯一集医疗、教学、科研为一体感染病专科。由发热门诊、肠道门诊、肝病门诊、艾滋病咨询门诊及感染病住院部组成。科室现有医护人员21人，其中副主任医师1名，主治医师2名，住院医师4人，副主任护师1名，主管护师1名，护师10名。科室设有各类感染病专科床位共36张；设有本县唯一具备国家资质的乙肝DNA分子生物实验室。
　　感染科技术水平
　　感染病科以肝炎、结核两大疾病为特色。对各种病毒性肝炎、药物性肝炎、酒精性肝炎、肝硬化、顽固性腹水，肺结核、结核性脑炎、耐药结核及重症结核诊治有丰富临床经验。对发热出疹性疾病、破伤风、重型脑炎、肺结核伴大咯血、重型肝炎，乙肝肝硬化并消化道出血、肝性脑病等抢救方面在本县内处于领先水平。2005年率先在该县开展了慢性乙型病毒性肝炎及丙型肝炎抗病毒治疗，有效减少了肝硬化和肝癌发生率。采取国际“金标准”“干扰素加利巴韦林”疗法治疗丙型肝炎；根据2015年“丙肝指南”更新对不能耐受“干扰素”治疗的丙型肝炎及丙型肝炎肝硬化代偿期病人，采用口服“索菲尼+达可丁钠”治疗84天的疗程替代“干扰素”治疗1年的疗程的方案治疗丙型肝炎治愈率达到95%以上。为该县艾滋病定点医院。负责艾滋病的管理及诊治，并参与及指导全县传染病及突发公共卫生的处理。负责全县及全院抗菌药物的指导及培训任务。
　　感染病科办科理念
　　以创新争先、拼搏奉献为办科精神；以设施设备人性化、服务人性化为办科理念；以配合政府，健全公共卫生系统，依托医院，促进专业学科发展为战略思想；力争把感染病科建设成为云阳县名科，能及时应对各种传染病及突发公共卫生事件的权威医疗机构。
　　感染病科现有及未来设备规划
　　建立分子生物实验室及细菌实验室：开展乙肝DNA、丙肝RNA监测、HBV分型及核苷类似物耐药检测；开展细菌培养及结核分支杆菌培养及利福平耐药监测；开展腹水浓缩回吸收治疗顽固性腹水；开展肝活组织检查、专业彩超及无创肝纤维硬度超声等检查来诊断早期肝硬化、肝癌及疑难肝病原因。