中关村医院病理科是该院重要临床辅助科室之一，承担着本院全部组织病理学诊断、细胞病理学诊断。主要开展了活体组织检查、术中快速病理诊断、脱落细胞学检查等项目，同时引进了先进的液基薄层细胞学技术（TCT）、免疫组织化学等辅助诊断技、人乳头状瘤病毒HPV DNA检测，平均每年可完成本院临床外检病理诊断1000余例，细胞学诊断25000余例，科室在消化病理和细胞学病理诊断方面有较丰富经验，具有一定的专业优势。最近拟开展原位杂交新技术。
　　该科除开展本院的业务外，还担负北京市政府妇女两癌筛查的宫颈细胞学检查任务，多家体检中心妇科细胞学检查，以及苏家坨、北安河、聂各庄等卫生院的妇科细胞学检查，及与中科院部分科研所合作开展科研工作。
　　另外科室还与北京大学病理系、北京大学人民医院病理科、北京友谊医院病理科等三级医院病理科保持良好的业务关系拥有可靠的技术平台，病理诊断准确率较高；同时我科病理报告发出时间及时是一大特色，并且开展协助患者到上级医院会诊的业务。最近，聘请北京大学病理系著名专家廖松林教授为我科客座教授。全科人员曾多次外出学习，技术水平不断提高。
　　人员组成：副主任医师1人，主治医师1人，硕士研究生1人，技师1人。
　　仪器设备：全自动脱水机，自动包埋机，捞烤片机，Leica石蜡切片机，冰冻切片机，TCT制片机，以及多台OLYMBAS显微镜及细胞学检查工作站，Leica 三人共览显微镜系统及病理图文报告和分析系统。
　　开展项目：
1.TCT液基薄层细胞学技术
TCT液基薄层细胞学技术是目前最先进的专门筛查宫颈癌前病变，预防宫颈癌发生的技术，可简单地称为宫颈防癌检查，其对宫颈病变的检出率远远高于传统的巴氏涂片。它可以侦察到最早期的癌前期病变，病变若能及早发现，则只需在妇科门诊进行简单手术，治愈率高达100%。
2.活体组织检查
通过各种手术方法从患者身体获取病变组织，或从体内排出的组织，均应进行病理检查（保存方法另见备注）。这种检查可以及时、准确地对疾病做出诊断，这是早期发现癌前病变及癌的最直接、可靠的方法。
3.免疫组织化学检测
免疫组化检测主要为患者的预后、手术方案的选择及治疗提供依据。如完全性葡萄胎和部分性葡萄胎，临床上的治疗和预后大不相同，可以通过检测P57的表达，来明确诊断。我科现已开展的免疫组化项目有30余项如雌激素受体( ER)、孕激素受体(PR)、C-erbB-2(HER-2／neu)、P53、CK、S-100、SMA、CD20、CD3、TS、TOPO2等。
4.冰冻快速病理诊断
报告时间短，30分钟出报告，能在手术中提供良、恶性的诊断，为临床大夫制定手术方案及手术范围提供帮助。
5.人乳头状瘤病毒HPV DNA检测
人类乳头瘤状病毒HPV基因检测（简称HPV-DNA）是目前宫颈癌早期检查的重要手段之一，与超薄细胞学检查联合应用能大大提高早期宫颈疾病的检出率。起到早发现、早预防、早治疗的作用，是常规病理检查所做不到的；是超薄细胞学检查的补充和进一步检查的必要项目。根据WHO的观点：HPV-DNA检查和超薄细胞学检查均为阴性者，8年内宫颈癌发生率几乎为0。所以说，该项检查对宫颈癌防治有重大意义。