1959年医院成立了病理室，1978年改为病理科，2007年更名为临床病理科，经过50余年的发展，已成为医疗、科研和教学为一体的延边地区的病理会诊中心。科室技术力量雄厚，现有硕士生导师2名，副高级职称4名，中级职称4名，其中博士学位1名，硕士学位3名。
　　近几年病理科活检和细胞学检查例数每年以10%增加，预计今年活检和细胞学检查均超过8000例，活检和细胞学诊断准确率98%以上，术中快速冰冻诊断准确率96%以上。
　　1.开展活体组织和各种细胞学检查(各种体液、刷检、细针穿刺细胞学)，
　　2.开展术中快速冰冻诊断，每年500多例，
　　3.开展20多种组织化学和30多种免疫组化染色，
　　4.作为本地区的病理会诊中心，每年完成各县级医院病理会诊数百例。
　　5.开展临床基因扩增检测，主要检测HBV DNA和HCVRNA，每年检测4000多例。
　　科室各种仪器、设备齐全，现有德国Leica冰冻切片机、英国山顿自动脱水机，自动染色机，德国Leica切片机，日本超低温冰柜，彩色病理图象分析系统2台，Olympus多头显微镜1台，Olympus双筒显微镜4台、液基细胞制片系统一台。定量PCR仪等 PCR扩增仪3台、美国BioRad-550酶标仪一台、高速离心机、低温离心机，电泳仪等。临床基因扩增检测实验室2006年7月经卫生部临检中心验收合格，是延边地区唯一经卫生部验收合格的临床基因扩增检测实验室。