中医科成立于1993年，是该院继大内科、大外科后成立最早的科室之一。目前设有中医门诊、针灸推拿室、中西医结合病房和中医学教研室 。
　　医疗：
（1）门诊选派临床经验丰富的高年资医师坐诊。设有中风后遗症、头痛眩晕症、慢性腰腿痛、老年冠心病、2型糖尿病、乙型肝炎、中晚期肿瘤、慢性结肠炎、更年期综合征等中医专科门诊。其中以中药为主治疗中风后遗症、头痛眩晕症、冠心病心绞痛、2型糖尿病、乙型肝炎、慢性肾小球肾炎、月经不调和更年期综合征等病证达到省内同行先进水平。
（2）针灸推拿室开展手针、电针、艾灸、火罐、理疗、推拿按摩、针刺减肥、中药汽化药熏蒸、中药穴位敷帖、穴位埋线等多项目的综合治疗。设有中风后遗症、慢性腰腿痛、针灸减肥、针灸治疗面神经炎等专病门诊。其中以中药穴位敷帖治疗急、慢性呼吸系统疾病、针推结合治疗面神经炎、中风后遗症、慢性腰腿痛为科室特色，其疗效居省内同行先进水平。。
（3）中西医结合病房收治非手术治疗的各种内、外科疾病。根据该科20多年的临床经验总结和疗效观察，目前确定以中风后遗症、慢性腰腿痛、中晚期肿瘤（肺癌、肝癌）病人为科室收治重点。病房严格坚持三级查房制度和疑难病症及时请院内相关科室会诊的制度，以确保患者得到及时、有效的诊断和治疗。
　　教学：
自1994年以来，先后承担中南大学湘雅医学院五年制本科生、七年制硕士生、八年制博士生的中医学教学任务和湘雅三医院实习生、进修生、住陪医师的中医临床教学任务。开展了培养中西医结合临床博士、硕士研究生的工作。现巳培养博士生3名，硕士生16名。
科研：
近5年来，该科承担各项科研课题10项，其中国家自然科学基金课题 1项，省级课题16 项（省自然科学基金课题3项，卫生厅重点课题2项，省科技厅攻关项目3项，其他课题 8 项），获湖南省中医药科技一等奖一项。发表论文50余篇。
　　人才结构：
中医科现有医护人员20余人，其中国家名老中医（正教授、博士研究生导师）1名，正教授2名，副教授3名，高年资主治医师3名，推拿按摩师3名，针灸技术员2名，在读博士生1名，硕士生2名。
　　专科特色
特色医疗：
（1）中西结合治疗中风后遗症、椎动脉供血不足。
（2）中药穴位敷帖和中药雾化吸入治疗急、慢性呼吸系统疾病。
（3）中药、针灸、推拿、牵引、穴位埋线综合治疗慢性颈、肩、腰腿疾病