厦门市第二医院呼吸肿瘤内科内设呼吸科、肿瘤科及胸外科，拥有国内一流的技术及设备。中心有医务人员40余人，其中主任医师6人，副主任医师4人。成立以来添置医疗设备近千万元，在省内首先引进气道超声设备、内科电子胸腔镜、气道冷激发试验设备、体内伽玛刀肿瘤治疗设备，在市内首先引进冷循环微波刀治疗设备、氩气刀及冷冻治疗设备，拥有各种规格的电子及纤维支气管镜，是福建省Pentax电子支气管镜培训中心。市呼吸中心在肺癌的诊断及治疗、在老年呼吸疾病的诊治、在肺部疾病的鉴别诊断具有一流的水平，在支气管镜介入诊疗及恶性肿瘤的微创介入治疗方面优势明显。中心在省内首先开展了放射性粒子植入（体内伽玛刀）治疗肿瘤、微波热凝固治疗肺癌、内科电子胸腔镜检查、气道超声检查、气道冷激发试验、经支气管镜植入放射性粒子、氩气刀治疗等，在市内首先开展了经支气管镜置入支架、冷冻治疗等。