厦门大学附属第一医院心脏外科正式成立于1994年，并率先在闽西南地区开展了首例体外循环心脏直视手术。科室经过数年不懈的努力，现已成为厦门市及闽西南地区心血管外科疾病防治中心之一。 2010年，随着林链凤、单忠贵等心脏外科专家的引进，学科得到了进一步发展；小儿先天性心脏病逐步向复杂先心方向发展，低体重、小婴儿先天性心脏病外科手术例数明显增多，短时间内科室独立完成了FONTAN、TECD根治、PECD根治、AVSD根治、DORV矫治、DCRV矫治、TOF根治、小儿瓣膜成形及置换等复杂先心手术；不仅如此，心外科还积极开展国际新技术、新方法，针对婴幼儿及部分成人胸腔小、肋骨弹性大、胸廓侧壁肌肉薄弱等特点，科室采用右外侧小切口剖胸矫治心脏畸形的手术路径，极大提高了患者日后的生活质量；而针对部分先天性心脏病患者，采用直视下经胸壁小切口置入封堵器技术，极大的缩短了患者的住院时间；成人心脏病方面，冠脉搭桥、大血管置换、主动脉瘤/夹层杂交技术、高龄患者瓣膜置换等复杂术式成为了科室新的发展方向，升主动脉置换同期冠状动脉移植、不停跳冠脉搭桥、再次瓣膜置换、主动脉弓部瘤等高难度手术方式均成为了科室常规开展术式；同时，心脏外科积极顺应国际发展趋势，将心脏外科手术从单一的结构的纠正转变到与电生理治疗相结合层次，率先在省内开展瓣膜置换及同期射频消融治疗，房颤转复率达国内外先进水平，有效提高了患者的生存质量。 科室技术力量雄厚，设备完善，心脏研究所监护室参照国外心脏中心治疗模式，设置独立的手术间及重症监护系统，配备万级层流监护室1 间，拥有世界上最先进的大型医疗设备，包括最先进的多功能护理床、中央工作站、全套床边心电监护系统、Sorin-C5型体外循环机，Siemens成人和婴幼儿专用呼吸机、持续心排量监测仪、除颤器，起博器，主动脉球囊反搏泵，血气分析仪、血液透析机、床边X光机、床边心脏超声仪、各种输液推泵、全套心肺复苏抢救设备与配套设施。层流监护室配置可适应开展心脏或心肺联合移植手术，为患者的康复提供高效安全可靠的保障。 科室非常重视学科的团队建设，现有主任医师3名，教授、硕士生导师1名，副教授、硕士生导师1名，医学博士3名，医学硕士3名，国外高级访问学者2名。在各级科学技术协会担任职务有：福建省胸心外科学会名誉主任委员2名，福建省器官移植学术委员会委员1名，副主任委员1名，常委1名；中国医师协会心血管外科分会全国委员3名，厦门市胸心外科学术委员会常委4名。