神经外科，是厦门市最早创建的专业学科，40余年来为闽南地区培养了一大批神经外科专业技术人才，经过几代人的不懈努力，现已发展成为一个人才梯队合理、专业结构齐全，医疗、教学、科研三位一体的闽西南地区一流的神经外科治疗中心。学科下设神经系统肿瘤、脑血管病、颅脑损伤、以及癫痫和疼痛等疾病专业治疗组。同时，瞄准国际发展前沿，相继开展了显微神经外科、血管内介入神经外科、功能神经外科、内窥镜神经外科以及微侵袭神经外科等亚专业学科。
　　神经外科具有一批德才兼备、高素质的专业学术队伍，其中享受国务院政府津贴专家1名，教授、主任医师1名，副教授、副主任医师5名，博士2名，硕士4名，留学回国专家1名。他们年富力强、学识渊博、团结协作、勇于创新，先后开展了光动力治疗恶性脑肿瘤、经OMMAYA囊局部化疗治疗恶性脑肿瘤、
　　碘125间质内放射治疗恶性脑肿瘤、神经内镜辅助下经鼻-蝶窦鞍区肿瘤切除、神经导航引导下锁孔手术等多项新业务、新技术，颅内肿瘤的综合治疗达到国内先进水平。同时还开展了颅颈交界区畸形、颅底肿瘤、脑干肿瘤等难治性神经外科疾病的手术治疗，并取得良好效果，成为深受广大患者欢迎的先进的专业学科。
　　神经外科拥有当前国际上最前沿的医疗设备，包括美国史塞克神经导航手术系统、德国蔡司、莱卡高端配置手术显微镜、德国蛇牌神经内窥镜、美国美敦力高速气动磨钻、德国蛇牌电动开颅工具、加拿大OWL射频治疗仪、德国蛇牌双极电凝系统、德国都乐多功能头架及自动牵开系统等。同时科室设有先进的神经外科专用重症监护病房（NICU），配备国内一流的生命监护和生命支持系统，以及德国德尔格呼吸机、美国强生血气分析仪等危重病人抢救设备，可以确保重症患者得到及时有效的监护与治疗。
　　神经外科紧跟专业国际发展前沿，先后开展了多项国内、省内重大课题研究，例如2005年获得的国家人事部留学归国人员重点资助课题“抑癌基因表达与胶质瘤化疗敏感性的关系”，标志着学科在脑肿瘤研究方面走在了国内前列。近2年来，科室相继开展的科研课题包括国家级课题三项、省部级课题四项、厦门市攻关课题六项，已获得省部级以上科技进步奖六项。在国内外权威学术刊物上发表论文100余篇，主编及参编神经外科专著11部。继往开来，神经外科全体医护人员将继续努力，以“一流的技术、一流的设备、一流的服务”为目标，以人为本，力争为广大患者提供全方位、优质的医疗服务，为我国的医疗卫生事业发展做出新的贡献。