自治区人民医院乳腺、甲状腺一科的前身是1978年组建的肿瘤专业组，1989年成立肿瘤外科，2008年3月从肿瘤外科分出，2012年正式更名为乳腺、甲状腺一科。该科拥有一批国内外高精尖医疗、科研、教学仪器，是以甲状腺及甲状旁腺良、恶性肿瘤，乳腺良、恶性肿瘤等诊断治疗为主要特色的专业科室，与疆内外多家医院建立了良好的协作关系。现有床位48张，医护人员24名，其中主任医师3名、副主任医师3名、副主任护师1名，其中博士1名、硕士2名、在读硕士1名。年门诊量1万余人次，住院病人1500余人次，手术1200余例。
　　目前该科开展的大多数诊疗项目居自治区或西北地区领先水平，其中包括乳腺癌改良根治术、保留肋间臂神经的乳癌改良根治术、早期乳腺癌的保乳术、前哨淋巴结活检术、早期乳腺癌保乳手术、乳腺癌术后乳房再造术、各种乳腺良性疾病的微创手术、乳腺钼靶、B超定位下乳腺微病变切除术、局部晚期乳腺癌的术前放化疗及内分泌、分子靶向治疗、免疫调节等综合治疗、解剖喉返神经及保留甲状旁腺的甲状腺叶切除术、全甲状腺腺叶切除术、难度较大、风险较高的巨大结节性甲状腺肿及胸内甲状腺的切除术、甲状腺癌根治术、甲状腺癌联合根治术、颈淋巴结清扫术、再次甲状腺手术喉返神经松解术及腔镜下甲状腺切除术等。该科采取功能性颈淋巴结清除术，除过去保留胸锁乳突肌、颈内静脉及副神经外进一步保留耳大神经、枕小神经、锁骨上皮神经、颈外静脉、颈横动、静脉的多功能保留颈淋巴结清除术，兼顾患者功能保留和完好外观，最大限度提高患者术后的生存质量。慕名而来的疆内外及周边中亚国家的患者络绎不绝。同时，该科加强对急、危、重疑难疾病分析诊疗工作。
　　近年来发表省级及国家核心期刊专业学术论文数54篇，其中2篇被SCI收录，并承担着新疆医科大学及石河子大学医学院的临床教学和理论教学任务及疆内外基层医院的进修培训工作，先后多次被评为“先进科室”。
　　自治区人民医院乳腺、甲状腺二科集科研、教学、临床诊疗为一体，于2008年3月由原肿瘤外科分出成立，2012年正式更名为乳腺、甲状腺二科，是治疗乳腺肿瘤、甲状腺疾病及体表肿瘤的专业科室，是自治区肿瘤防治重点发展学科。拥有早期乳腺癌保乳治疗的淋巴导航系统、安珂乳腺旋切系统、早期乳腺癌诊断的钼靶X线摄相机、彩色多普勒B型超声波、乳腺专用核磁成像系统，早期诊断全身肿瘤疾病的PET（派特）-CT及甲状腺ECT等先进设备。现有床位38张，医护人员21人，其中主任医师2人、副主任医师2人、主管护理师2人，硕士4人。年门诊量9000余人次，年手术700余例。
　　该科有一支技术过硬、经验丰富的专业技术人员队伍，具有先进的医学理念及专业治疗保障，对乳腺、甲状腺良性、恶性肿瘤的治疗施行标准化和个体化，乳腺疾病的诊断、手术及综合治疗水平居新疆前列。率先在疆内开展淋巴导航系统引导下乳腺癌保乳手术，乳腺癌根治加一期假体植入术、巨大甲状腺肿瘤切除、甲状腺旁腺肿瘤的诊治、乳腺良性肿瘤微创手术。在甲状腺肿瘤及全身体表肿瘤诊治方面尤以专科治疗、个体化治疗见长，并为同行所称道。
　　科室重视对基层医疗单位的技术支持及帮扶，多次前往南北疆开展巡回医疗工作，为基层单位的学科发展做出了积极贡献。科室团队荣获院内科技进步新成果奖10余项，发表学术论文20余篇。
　　该科护理组积极开展超声引导下PICC穿刺技术、输液港维护等先进护理技术，为病人提供全程、全方位、无缝隙的整体护理服务，多次被医院评为“优质护理服务单元”。