该科成立于８０年代初期，现拥有床位60张，是自治区人民医院重点发展科室．该科技术力量雄厚，现有医师１３名，其中主任医师２名，副主任医师２名，主治医师４名，硕士生导师１名，整体人才结构具有较大的优势和发展潜力．配有一个１４张床位的现代化ＩＣＵ和两间百级手术间．此外，还拥有国际先进的Sarn人工心肺机，麻醉机，主动脉球囊反搏机和多种监护仪等．现手术已达500余例。
　　主要开展业务
　　室间隔缺损修补及封堵术，动脉导管未闭手术结扎及封堵术，心内膜垫缺损修补，单心室的单、双向格林手术，大动脉转位调转术，各种心脏瓣膜病，冠心病，各种心脏肿瘤及大动脉瘤，其中有些手术难度极大的疾病，如马凡氏综合征，重症心脏瓣膜病，瓣膜病联合冠心病，急性心肌梗塞急诊冠脉搭桥术的治疗，主动脉夹层动脉瘤急诊行BENTALL手术等。
　　科室特色
　　1、在疆内首先开展了低体重婴幼儿复杂先天性心脏病的矫治，最低体重5公斤。对于小儿先天性心脏病采用右腋下小切口及胸骨下段小切口，优点为创伤小，切口短，恢复快。
　　2、冠脉搭桥数开展料各种方式的动脉系统冠脉搭桥术（旁路移植术）如左，右胸廓内动脉，桡动脉，胃网膜右动脉，手术约400例，并荣获新疆自治区科技进步三等奖。首先在新疆开通了冠心病绿色通道，急性心梗六小时内可行急诊冠脉搭桥术，处于国内先进水平。
　　3、主动脉外科方面：主动脉夹层急性期进行及急诊手术，包括Ｂｅｎｔａｌｌ，ｃａｂｒｏｌ，ｗｈｅａｔ等手术。胸主动脉瘤切除加人工血管置换术，带瓣全主动脉弓置换术，右锁骨下动脉插管选择性灌注应用象鼻技术治疗ｄｅｂａｋｅｙＩ型夹层动脉瘤达到国际先进水平。
　　4、器官移植方面：于内地专家协作率先在疆内完成了首例同种异体原位心脏移植，填补了新疆空白。
　　科室特点：该科与急救中心，心内科起搏中心联合在新疆自治区开展了三个急救绿色通道，其一，冠心病绿色通道。其二，主动脉大血管绿色通道。其三，各类瓣膜急性病变绿色通道