腔镜外科在原普外二科腹腔镜组的基础上于2002年成立。现设固定病床39张，医护人员20名 ，其中主任医师1名、副主任医师2名、主治医师2名、住院医师4名、在读研究生1名、教授、副教授各1名，主管护师1名、护理师6名、护士4名。

　　该科配有3套腹腔镜设备，模拟腹腔镜训练器1套，技术力量雄厚，技术达到全国先进水平。已完成腹腔镜下胆囊切除术2万例。

　　该科在新疆率先开展多种并填补了多项区内空白，目前可开展腹腔镜下胆囊切除术、胆总管探查、造影、脾切除术、阑尾切除术、结肠切除术、直肠切除术、小肠切除、胃平滑肌瘤摘除、肝血管瘤肝不规则切除术、肝肾囊肿引流无水酒精灌洗术、 肠系膜囊肿切除术、肠粘连送解术、腹腔镜下无张力疝修补术、隔疝修补，小儿腹腔镜内环口关闭术、腹腔镜下肝包虫内囊摘除术、诊断性手术、子宫全切术、卵巢畸胎瘤切除术、卵巢囊肿切除术、原发不孕症的诊断及输卵管再通术、宫外孕的诊断及治疗、各种腹腔肿瘤的取活捡术及治疗，手助式腹腔镜手术、各种腹腔镜下联合手术等。是全疆腹腔镜手术种类最全、数量最多的专科。