眼科成立于1937年，现已发展为医疗、科研、教学水平居国内先进水平的一级临床科室。著名专家刘新民、陈庆魁、王守敬、王蔼青、臧企、孙乃学、熊全臣教授先后主持工作。1963年被批准为陕西省首批研究室之一，1986年被批准为硕士学位授予点，1998年成为眼科专业国家临床药物试验机构，同年陕西省防盲办依托在该科设立，2004年被评为陕西省优势医疗专科。
　　眼科技术力量雄厚，现有医生20人，其中教授6人，副教授3人；护理医技人员27人，其中副主任技师1人，主管护（技）师11人。
　　该学科专业门类齐全，各种诊疗设备先进。拥有病床50张。年门诊病人量20000人次，年住院病人量与手术量均超过1000人次，设青光眼、白内障、角膜病、眼底病、眼眶病、眼部整形、泪道病、屈光、斜视弱视等专业组。拥有多波长激光、准分子激光、YAG激光、泪道激光、玻璃体切割仪、白内障超声乳化仪、蔡司手术显微镜、Humphrey视野计、OCT、UBM、多焦视觉电生理仪、视网膜脉络膜血管荧光造影系统、Ａ/Ｂ超声、角膜地形图、角膜内皮镜等国际新型的先进医疗设备。
　　学科专家长期参与中华眼科学会、陕西省眼科学会和西安市眼科学会的组织领导工作。主编、参编眼科专业著作20余部。承担国家自然科学基金、国家“九五”攻关项目和省部级科研项目30余项，并获省市科技奖四项。承担西安交通大学博士、硕士研究生、留学生、本科生及进修生等的教学任务，有博士生导师1名，硕士生导师6名，已培养博士、硕士研究生50余名。重视国际交流与合作，有6人曾出国学习深造，多次邀请国外著名专家前来院交流。
　　医疗优势及特色：
　　1．角膜移植术；
　　2．青光眼的早期诊断与治疗；
　　3．玻璃体切割术治疗严重眼外伤、复杂性视网膜脱离及增殖性视网膜病变；
　　4．眼底病的诊断与治疗；
　　5．白内障超声乳化术加人工晶体植入术；
　　6．泪囊炎手术治疗、泪小管断裂吻合术；
　　7．磁性及非磁性眼球异物取出术；
　　8．新生儿泪囊炎的治疗；
　　9．复杂性斜视的手术治疗；
　　10．屈光不正矫治与弱视治疗；
　　11．眼肿瘤与眼眶病的治疗；
　　12．糖尿病性视网膜病变的治疗；
　　13．眼部整形与美容；
　　14．眼前节超声生物显微镜（UBM）检查；
　　15.视网膜脉络膜血管荧光造影；
　　16.OCT检查