温州医科大学附属第二医院心胸外科成立于上世纪80年代，是中华医学会浙江省分会委员单位、省小儿心胸外科副主委单位；是温州医科大学心胸外科硕士学位授予点。近3年来承担省部级课题3项、厅局级课题多项，发表SCI论文3篇、中华系列论著20余篇。学科集临床、教学、科研于一体，积极探索心胸外科各项新技术为广大患者服务。
　　技术优势：
　　1、各种先天性心脏病的治疗。千名出生婴儿约6-7名患有先天性心脏病，若未及时治疗许多患儿将夭折。上世纪80年代末期科在浙南地区率先开展先天性心脏病的外科治疗，目前病例数达5000余例，成功率达98%以上。尤其在各种复杂先天性心脏病的治疗（包括外科治疗、杂交治疗等）取得了许多突破性的进展。如：无血预充体外循环心内直视手术；完全性大动脉转位解剖矫治术；经左房顶部径路纠治心上型完全性肺静脉异位引流；单心室矫治术；复杂法洛四联症纠治术；经胸骨正中切口一期纠治主动脉缩窄合并心内畸形；非体外循环下双向Glenn手术治疗紫绀型复杂先心病；极低体重新生儿的心内直视术等。
　　2、各种获得性心脏病的外科治疗。我国随着经济的发展人民生活水平的提高，人类寿命大大延长。冠心病、退行性心脏瓣膜病、大血管疾病的发病率逐年增高。科早在上世纪90年代初期已经开展瓣膜性心脏病的外科治疗，近10余年来进一步开展冠心病停跳或非停跳搭桥术，A型主动脉夹层外科治疗、B型主动脉夹层DSA下腔内隔绝术及复杂主动脉夹层的杂交手术，心律失常的心内直视术。
　　3、微创技术在心胸外科的应用。微创外科是目前外科技术的热点，也是以后外科发展的方向。科已经常规开展胸腔镜下肺癌、食管癌的外科治疗，胸腔镜辅助下漏斗胸Nuss术，纵隔肿瘤、脓胸、多汗症等多种胸外科疾病的微创手术。