心血管内科是温州医科大学附属第二医院的院级重点学科。目前拥有3个病区，常年开设床位132张，其中监护室病床21张。学科专用设备资产超过2500万元，设施先进。拥有DSA机2台，三维标测系统CARTO和ENSITE各一台，美国Pruka64导电生理仪两台与射频仪两台，惠普24小时心电监测仪，动态血压心电监护系统、除颤仪，心电图机等仪器，以上多项仪器处于省市领先水平。重症监护病房及介入导管室（DSA）均配备完整。
　　心血管内科专业共有医务人员50余人，教授（主任医师）6人，副主任医师9人，博士1人，硕士20余人，5人为硕士研究生导师。学科开设心血管疾病、高血压病、心律失常、起搏器随访等专科门诊，月均专科门诊量达到5000余人次。月均收住病人370余人次。1998年以来陆续开展选择性冠状动脉造影术、冠状动脉腔内支架植入术、生理起搏器植入术、多腔起搏器植入术、经皮二尖瓣球囊成形术、肾动脉成形术、Amplatez伞堵术、急性心肌梗死急诊PCI、冠状动脉腔内血管超声检查术、切割球囊治疗严重复杂冠状动脉病变、射频治疗各种快速心律失常等一系列国内先进的心脏介入诊疗技术；2003年以来与心胸外科合作完成的同种原位心脏移植，该患者成活时间已超过十年，使温州地区的大器官移植达到了新的水平。2008年和2012年分别在浙南地区率先独立开展了房颤导管消融术、冠脉坏死闭塞病变逆行导丝开通技术，其手术例数、速度及成功率在浙南地区处于领先水平，且近几年在导管消融治疗室性心律失常方面已达国内甚至国际领先水平，目前已有省外患者慕名前来科做此类手术，使院心内科介入水平达到国内先进水平。
　　目前心内科承担承担国家自然科学基金2项，省部级课题6项，是国家药物临床试验基地，近5年发表SCI论文26篇。参与国际国内多中心大规模临床研究多项，成功举办多次国家级继续教育学习班和国际心脏病会议。