吴淞中心医院康复医学科是在原理疗科的基础上发展而成的，除原有的理疗项目（磁振热疗、短波治疗、微波治疗、低周波治疗、神经肌电促通、超声雾化、氦氖激光、电脑按摩、电脑中频、牵引等）外，增加了体疗、作业疗法以及先进的等速测试训练系统。拥有专业的康复医师主持日常治疗工作。开展了中风早期介入及中风后遗症康复治疗；颈、肩、腰腿痛康复治疗；手外伤、骨折术后功能障碍康复治疗；脑外伤康复治疗；慢性疼痛康复治疗等，使很多前来就诊的病人“病而不残、残而不废”。
吴淞中心医院康复医学科有康复医师4名，康复治疗师5名，其中主任医师（为上海市第一人民医院康复医学科专家）、副主任医师及各1名。
吴淞中心医院康复医学科拥有美国进口的Cybex等速测试训练仪，是目前国内先进的康复训练系统，主要用于骨折后关节功能训练，膝关节炎功能测试和训练等；丹麦进口神经网络重建仪，可帮助中风患者重建受损的神经网络。
医疗特色：
1、与神经内科联合开展中风早期康复介入及出院后偏瘫等各种功能障碍的康复治疗。
2、骨折后功能障碍、颈、肩、腰腿痛、急性腰扭伤、腰椎间盘突出症等康复治疗，开展关节松动术及Mckenzie手法等特色治疗。
3、妇科慢性腹痛(盆腔炎、内膜异位症、顽固性痛经)、不孕症（输卵管阻塞性不孕、黄体功能不全、免疫性不孕）、更年期综合症等中西医结合“四维立体”康复治疗。