该院神经内科是温州市的重点学科，是医院脑科中心的重要组成部分，科内设2个病区、80多张床位。现有主任医师4人、副主任医师3人、副主任护师1人。科室拥有神经电生理室，开展常规脑电图、视频脑电图、动态脑电图、肌电图的检查和诊断及经颅彩色多普勒(TCD)检查。2009年成立神经康复中心，拥有减重支持系统、德国进口功率车等先进的康复设施。开展运动疗法、作业疗法、物理因子治疗等神经康复治疗，对于早期卒中病人的康复效果明显。
科室技术力量雄厚，在抢救神经重症病方面积累了丰富的临床经验，对脑血管疾病、椎体外系疾病、癫痫、痴呆等，有较高的诊治水平；对神经系统疑难杂症的诊断及治疗也在逐步深入。近年开展的A型肉毒素治疗肌张力障碍、脑血管病、帕金森病的基础及临床治疗等项目已形成一定规模。
目前承担国家多中心“十一五”攻关课题1项，承担省卫生厅课题1项，市科技局课题6项，市卫生局课题6项。在国内神经病学专业杂志上发表学术论文近100篇。