武汉市传染病研究所是在武汉市卫生局、武汉市科委于2006年批准下成立的，下设免疫研究室、病毒研究室、传染病与肝病研究室等部门，依托武汉市医疗救治中心临床基地，现已发展成为集传染病临床与基础研究、临床医疗、教学为一体的综合性研究所。研究所以肝炎病毒、狂犬病毒及其所致疾病的诊断、治疗及预防为主要研究方向，在国内外同行中享有一定的地位和影响，是本院传染病学专业硕士培养基地。

    从2006年起，传染病研究所在对狂犬病毒分子生物学、狂犬病患者的脑脊液改变以及狂犬病基因诊断技术的研究方面承担着省卫生厅科技攻关，罗伯特•博世基金会“中德科学桥”资助项目，武汉市科技计划项目的多类基金资助课题。先后进行了乙型肝炎基因疫苗的实验研究、新型分子免疫佐剂增强丙型肝炎疫苗的研究、狂犬病分子生物学特征与发病机理的研究、狂犬病脑脊液生物喋呤和单胺类神经递质与神经功能紊乱的研究等重点研究课题，取得了初步的研究成果，在国内外发表了一定数量的研究论文。通过这些研究，传染病研究所在现代生命科学研究条件和设备、技术上都有一定的积累和发展，具备了进行基因、蛋白质、免疫学、组织形态学和血清等一系列先进研究的技术和条件。

    传染病研究所与德国、美国、加拿大、日本等国内外同行有着广泛、密切的科技合作和友好的学术交流关系，涉及基础研究诊断技术和临床治疗等不同领域。这些合作项目大大促进了研究所的学术水平、技术水平的提高和发展。