肛肠科是全市重点学科之一，经过20多年的发展，中西医结合治疗肛肠科常见病、疑难杂症等在温岭具有较大的影响力。并先后与全国中医肛肠病治疗中心— 南京市中医院肛肠科及浙一医院肛肠科开展技术合作后，肛肠科的发展步伐更加迅速。年门诊量近10000人次，年收治病人700多人，年手术600余例 （其中Ⅲ类手术300余例），诊治病种达30余个。目前肛肠科医资力量雄厚， 拥有正副主任医师6名、主治医师3名，开放床位32张，是台州地区唯一拥有独立病区的肛肠科，开展排粪造影、结肠运输试验、电子结肠镜等专科检查。一大批新技术、新项目不断开展。引进美国爱诺康消化道一次性吻合器用于直肠癌低位保肛手术，在内镜下行高频电凝肉切除术，超声雾化熏洗仪用于肛部手术后创面护理，电脑灌肠仪治疗慢性肠炎、溃疡性结肠炎，在全市开创先河。开展出口、结肠梗阻型慢性便秘（直肠内套叠、直肠前突、耻骨肌综合症、乙状结肠内疝）、先天性肛门闭锁、直肠阴道瘘、大肠癌等高难度手术，开展无痛环状痔PPh手术，同时运用中西医结合解决痔疮、肛瘘、肛裂、肛周脓肿等常见疾患，开设便秘及慢性肠炎专病门诊，疗效显著。慢性便秘的诊治课题被市科技局立项，近年来发表国家省级论文30余篇。本科技术力量、检查设施在本市处于领先地位。