1973年成立麻醉科，拥有现代化层流手术室14间，另设麻醉恢复室。每间手术室都配有较高档的进口麻醉机或麻醉工作站及多参数监护仪，配备先进的无创心功能监测仪和麻醉深度监测仪、麻醉气体监测仪、肌松监测仪和动脉血气分析仪等监测设备。主要承担全院各科择期手术病人临床麻醉和超声聚焦刀肿瘤治疗系统(HiFu)的麻醉任务，并开展癌性疼痛和术后疼痛的治疗和急救复苏等工作。每年完成手术约3500例次，全身麻醉占90%以上，其中手术难度较大、切除范围较广和疑难病例的麻醉占总麻醉数的60%以上，老年病人占30%以上。建科以来共完成临床麻醉7万余人次，无重大差错和麻醉意外死亡发生。

       现有医生22名及专职麻醉护士1名，有良好的专业人才梯队和后备力量。其中正主任医师1名，副主任医师3名，主治医师9名，住院医师9名，具有硕士(博士)学位9名，另有3名硕士在读。正副主任医师分别在省、市医学会麻醉分会任职，并担任南京医学会医疗事故技术鉴定专家库成员和《临床麻醉学杂志》审稿专家。

        该科在国内最早开展肺癌袖状切除术的麻醉，开展高难度气管肿瘤切除重建和隆突部肿瘤切除及隆突重建术的麻醉；对气管肿瘤采用术中 “张缩气囊”导管管理呼吸方法，属省内首创，具有操作简单、易行、通气效果可靠，无缺氧和二氧化碳蓄积，不影响手术进行等优点。1994年该科在省内率先按WHO要求，对癌痛病人实行三阶梯镇痛疗法，减轻了病人痛苦，提高了病人生存质量，防止了不规范用药。特别是近年来我院陆续开展了一些疑难病例的手术，如同种异体原位肝移植、同种异体单肺移植、自体肺移植、非体外循环下上腔静脉置换等手术，麻醉技术水平更是上了一个台阶。