弋矶山医院中医科及中医学教研室成立于1973年，1981年被国务院学位委员会批准为具有中医<<内经>>后改为“中医基础理论”专业硕士学位授予点。学科现有医、教、研人员6人，其中教授、主任医师1人，主任医师、副教授1人，副主任医师4人。

　　科室特长：中医科为中医综合性科室，多年来积极开展对多种疑难病、肿瘤、风湿性疾病、妇科疾病、消化系统、泌尿系统、呼吸系统等疾病的中医特色疗法。发挥中医优势，积极开展和中老年病、脑血管疾病的后续治疗等多项专家、专病门诊和“治末病”抗衰保健门诊。参加全院会诊和天门山社区医疗服务。此外科室还开展了多功能局部中药薰蒸治疗风湿病及部分内科、妇科疾病等中医药特色新疗法。

　　教学方面：中医学教研室拥有素质较高的教师队伍，每年承担着研究生、本科、专科、成人教育等多层次、多系别、多班级的理论课及临床带教的教学任务，每年完成研究生和本科生教学300余学时。

　　科研方面：已完成省、厅级科研课题及成果12项，获省级自然科学奖和科技进步奖4项、厅级自然科学奖和科技进步奖6项、华东地区及安徽省优秀科技图书奖4项，目前在研项目有与北京中国中医科学院、清华大学合作的国家级自然科学基金重点项目一项、学院中青年科研基金项目二项、教学研究项目三项。出版著作32部，如：《济仁医录》《中国百年百名中医临床家》《新修本草》《本草人生》等，在国内外发表学术论文410余篇。

　　特别是在“新安医学”及新安医家诊疗经验的研究上卓有贡献。主编的《新安名医考》对新安医家进行了系统的挖掘整理，在此基础上主持的“新安名医考证研究”获1994年安徽省高校科技进步奖二等奖、1997年安徽省自然科学三等奖、首届全国优秀医史文献图书及医学工具书银奖。主持的安徽省重点项目“新安医家治疗急危难病症经验的研究”首次系统挖掘、提炼新安医家治疗急危难病症的基本特色与规律，并主编出版了《大医精要-新安医学研究》一书，该成果获2000年安徽省高校科技进步二等奖、2002年安徽省科学技术奖三等奖。主编的《新安医籍丛刊》获第九届华东六省一市优秀科技图书一等奖。